60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0779 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0779  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 467 aa  963    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000860096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3271  hypothetical protein  58.92 
 
 		 469 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3661  Carbohydrate-selective porin OprB  55.63 
 
 		 476 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3768  Carbohydrate-selective porin OprB  55.7 
 
 		 476 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2751  carbohydrate-selective porin OprB  29.61 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.202947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1112  hypothetical protein  28.42 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.503741  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  25.16 
 
 		 568 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1085  Carbohydrate-selective porin OprB  27.27 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000116954  decreased coverage  8.02155e-19 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1331  carbohydrate-selective porin OprB  23.39 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1590  Carbohydrate-selective porin OprB  23.26 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  22.95 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3166  Carbohydrate-selective porin OprB  24.22 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  hitchhiker  0.000000000149961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  23.45 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2951  Carbohydrate-selective porin OprB  23.18 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1665  Carbohydrate-selective porin OprB  23.18 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  22.84 
 
 		 598 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  22.3 
 
 		 662 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  24.16 
 
 		 692 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0352  carbohydrate-selective porin OprB  22 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  26.6 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  26.6 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  22.03 
 
 		 689 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2220  hypothetical protein  31.5 
 
 		 536 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000188992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  26.6 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  26.6 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  22.42 
 
 		 661 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2438  hypothetical protein  31.09 
 
 		 534 aa  53.9  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1454  hypothetical protein  22.45 
 
 		 665 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  22.36 
 
 		 606 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  21.92 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  21.89 
 
 		 674 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  21.89 
 
 		 710 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3545  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  23.45 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.339839 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  21.58 
 
 		 542 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4205  carbohydrate-selective porin OprB  24.4 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  24.34 
 
 		 680 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1057  carbohydrate-selective porin OprB  23.56 
 
 		 447 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1019  porin B  23.56 
 
 		 447 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1017  carbohydrate-selective porin OprB  23.56 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  24 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2127  Carbohydrate-selective porin OprB  23.81 
 
 		 494 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.96067  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  21.41 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0411  hypothetical protein  22.76 
 
 		 499 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  24.5 
 
 		 574 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1082  carbohydrate-selective porin OprB  19.64 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0774059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  22.13 
 
 		 527 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1195  hypothetical protein  21.5 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.282348  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4366  carbohydrate-selective porin OprB  21.52 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00370105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  19.52 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2711  carbohydrate-selective porin OprB  28.57 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.695739  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  23.57 
 
 		 693 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2351  carbohydrate-selective porin OprB  26.63 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.348926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2204  carbohydrate-selective porin OprB  26.63 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5436  carbohydrate-selective porin, OprB family  27.32 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390026  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  30 
 
 		 624 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3570  carbohydrate-selective porin OprB  26.63 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4992  Carbohydrate-selective porin OprB  21.67 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000230615  hitchhiker  0.00966153 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6797  Carbohydrate-selective porin OprB  20.85 
 
 		 458 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  22.03 
 
 		 670 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2957  carbohydrate-selective porin OprB  27.17 
 
 		 422 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  normal  0.40455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>