49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0771 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 185 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  73.08 
 
 		 188 aa  268  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  69.23 
 
 		 187 aa  255  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  67.76 
 
 		 183 aa  252  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  67.57 
 
 		 188 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  61.54 
 
 		 182 aa  235  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  62.43 
 
 		 182 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.5 
 
 		 202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 316 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  35.91 
 
 		 201 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.95 
 
 		 202 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.54 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.58 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.58 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.28 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.01 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.51 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  29.24 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  34.25 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  28.85 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  26.7 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.49 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.65 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.82 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.25 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.82 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  27.1 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  25.19 
 
 		 437 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0120  hypothetical protein  35.42 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  29.79 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  27.01 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  31.76 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.28 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  32.21 
 
 		 270 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  28.78 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12027  hypothetical protein  23.86 
 
 		 255 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000558386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2304  putative regulator of cell morphogenesis and NO signaling  31.58 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.904148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  26.45 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.43 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  31.63 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.14 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  28 
 
 		 148 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  23.27 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>