More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0759 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 222 aa  221  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.77 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.11 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.95 
 
 		 253 aa  178  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  46.7 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  44.55 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  44.55 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  44.08 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  46.95 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.12 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.25 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  43.6 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.26 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  43.13 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.39 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  43.13 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 303 aa  167  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  44.81 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  43.19 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  43.26 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  41.83 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  41.06 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.27 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.58 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.91 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.6 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  42.99 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5556  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 255 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  38.86 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 225 aa  157  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.81 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  42.18 
 
 		 239 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  45.02 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>