211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0723 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  100 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0624  CheW protein  41.54 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0638  CheW protein  41.54 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07762e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0075  CheW protein  36.69 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3197  purine-binding chemotaxis protein CheW, putative  33.08 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  30.3 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  26.12 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  32.58 
 
 		 779 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.7 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  29.7 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  33.03 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  29.7 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  31.34 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.71 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  31.58 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  24.31 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  26.32 
 
 		 331 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  25.9 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  27.19 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  25.84 
 
 		 365 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  32.97 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  25.36 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  27.48 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  36.99 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  26.19 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  29.79 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  31.87 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  25 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  25 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  25 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  32.69 
 
 		 907 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  41.51 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  28.72 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  24.17 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  26.67 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  29.2 
 
 		 568 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  29.2 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  30.77 
 
 		 184 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  40.35 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  30.3 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  26.47 
 
 		 200 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  27.72 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  26.8 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.76 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  34.12 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  37.93 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  27.37 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  25.71 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  24.29 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  24.49 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  24.29 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  23.57 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  29.03 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  34.48 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  23.81 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.76 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  24.26 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  25.84 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  26.88 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  27.73 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  33.72 
 
 		 212 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  35.63 
 
 		 212 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  25.84 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  27.08 
 
 		 520 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  23.6 
 
 		 365 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  23.77 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  23.47 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  25 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  32.11 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  41.67 
 
 		 168 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  38.27 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  27.83 
 
 		 201 aa  47.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  26.47 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  27.18 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  23.47 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  23.91 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  31.67 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  26.92 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  28.57 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  22.77 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  27.54 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  22.77 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  26.56 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  25 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  40.98 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  24.29 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3063  CheW protein  32.41 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  28.42 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  28.57 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  25.53 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>