More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0689 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  56.27 
 
 		 638 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.23 
 
 		 645 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 632 aa  1271    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  57.17 
 
 		 643 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.07 
 
 		 647 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.06 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  46.09 
 
 		 673 aa  535  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.89 
 
 		 624 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  45.29 
 
 		 423 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.05 
 
 		 406 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1676 aa  174  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 		 1737 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.8 
 
 		 818 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.37 
 
 		 1056 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 847 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.35 
 
 		 988 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 878 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.81 
 
 		 1022 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.23 
 
 		 1056 aa  137  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.25 
 
 		 810 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.82 
 
 		 784 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.45 
 
 		 2240 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.7 
 
 		 887 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.11 
 
 		 3301 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 3172 aa  121  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.58 
 
 		 936 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.72 
 
 		 725 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.42 
 
 		 884 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  23.36 
 
 		 681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  25.8 
 
 		 714 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 		 689 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 486 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 566 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.66 
 
 		 1154 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.17 
 
 		 573 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.14 
 
 		 837 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.22 
 
 		 573 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 3145 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  20.96 
 
 		 4079 aa  103  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.4 
 
 		 764 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 392 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 886 aa  103  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 		 1486 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 		 448 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.82 
 
 		 733 aa  100  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 594 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  27.91 
 
 		 594 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.11 
 
 		 832 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.76 
 
 		 729 aa  98.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 883 aa  97.4  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.02 
 
 		 561 aa  95.5  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 649 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.02 
 
 		 561 aa  95.5  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 722 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 377 aa  95.1  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 909 aa  94  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 573 aa  93.2  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 748 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 927 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 808 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.62 
 
 		 622 aa  91.3  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 602 aa  91.3  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.8 
 
 		 883 aa  90.9  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 767 aa  90.9  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.63 
 
 		 1694 aa  90.5  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 828 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.74 
 
 		 572 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 567 aa  90.1  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  23.09 
 
 		 795 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.52 
 
 		 632 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 828 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 681 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.62 
 
 		 738 aa  88.2  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 289 aa  88.2  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 		 2262 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1421 aa  87.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.03 
 
 		 572 aa  87.4  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.24 
 
 		 979 aa  87  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 827 aa  87  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.91 
 
 		 676 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1406 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 4489 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 274 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21.9 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  22.64 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  23.55 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 685 aa  84.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.96 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 762 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  23.8 
 
 		 864 aa  84  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 686 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 860 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 714 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 824 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.25 
 
 		 816 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>