156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0666 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  64.94 
 
 
176 aa  230  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  65.52 
 
 
175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  64.37 
 
 
188 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  62.64 
 
 
188 aa  208  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  68.71 
 
 
164 aa  207  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  63.79 
 
 
188 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  48.85 
 
 
179 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  44.51 
 
 
189 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  46.21 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  49.71 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  42.07 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  57.26 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  55.28 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  45.93 
 
 
178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  41.67 
 
 
184 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  41.07 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  41.46 
 
 
184 aa  124  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  40.48 
 
 
184 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  39.88 
 
 
184 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  39.88 
 
 
184 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  56.45 
 
 
194 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  39.88 
 
 
184 aa  121  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  54.4 
 
 
199 aa  121  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  48.04 
 
 
178 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  45.86 
 
 
181 aa  118  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  47.26 
 
 
183 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  50.39 
 
 
231 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  42.24 
 
 
178 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  44.68 
 
 
207 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  34.97 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  40.15 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  56 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  56.45 
 
 
185 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  37.23 
 
 
184 aa  104  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  42.07 
 
 
169 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  38.31 
 
 
159 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  44.26 
 
 
189 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  37.66 
 
 
159 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  36.42 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  41.96 
 
 
325 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  37.01 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  45.4 
 
 
178 aa  99  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  40.83 
 
 
159 aa  98.2  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  40.83 
 
 
159 aa  98.2  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  42.25 
 
 
182 aa  97.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  46.4 
 
 
324 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  39.68 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  39.68 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  39.15 
 
 
182 aa  94.4  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  38.62 
 
 
182 aa  94.4  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  36.88 
 
 
153 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  40.11 
 
 
182 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  40.11 
 
 
182 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  41.67 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  38.62 
 
 
182 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  40.11 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  43.22 
 
 
120 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  46.72 
 
 
323 aa  90.9  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  49.62 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  42.77 
 
 
405 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  42.77 
 
 
405 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  38.78 
 
 
202 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  35.26 
 
 
286 aa  86.7  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  40.14 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  41.89 
 
 
368 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  37.5 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  35.04 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  34.91 
 
 
449 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  41.35 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  39.52 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  40 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  41.94 
 
 
383 aa  82.4  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  31.52 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  36.53 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  43.05 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  46.61 
 
 
378 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  46.77 
 
 
392 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  39.19 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  41.13 
 
 
379 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  38.71 
 
 
373 aa  77  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  40.5 
 
 
165 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  39.52 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  44.8 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  38.46 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  40.16 
 
 
390 aa  75.1  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 
361 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  45.16 
 
 
387 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  46.46 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  41.8 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  40.32 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  40.32 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  38.21 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  44.88 
 
 
388 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  43.55 
 
 
382 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  43.55 
 
 
397 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  43.55 
 
 
397 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  43.55 
 
 
465 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  43.55 
 
 
382 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>