71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0600 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  71.43 
 
 
80 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  62.32 
 
 
69 aa  99.4  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  61.76 
 
 
75 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  53.62 
 
 
74 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  53.85 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  44.78 
 
 
72 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  52.31 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  48.53 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  53.23 
 
 
68 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  48.57 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  56.36 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  45.31 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  45.76 
 
 
81 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  48.28 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  39.13 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  40.58 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  44.9 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  38.33 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  33.87 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  37.88 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  32.86 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  32.86 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  43.75 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  40.62 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  39.68 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  35.29 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0592  hypothetical protein  44 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  37.7 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  38.24 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 
75 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  37.1 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  33.85 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  33.33 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  36.76 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  36.76 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  37.93 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  31.34 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  38.46 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  38.89 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  45.45 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  29.23 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  37.74 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  37.74 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1106  hypothetical protein  58.82 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  37.74 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  32.35 
 
 
71 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  31.15 
 
 
138 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  39.22 
 
 
56 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0087  hypothetical protein  53.57 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  37.31 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  33.87 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  31.75 
 
 
98 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  35.38 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  39.29 
 
 
72 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>