71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0500 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  100 
 
 		 1496 aa  2965    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  41.68 
 
 		 1289 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  55.99 
 
 		 1141 aa  352  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  32.73 
 
 		 939 aa  321  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  52.62 
 
 		 1439 aa  299  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  58.52 
 
 		 916 aa  297  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1157  hypothetical protein  33.89 
 
 		 642 aa  192  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  39.37 
 
 		 777 aa  173  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  44.14 
 
 		 675 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  38.48 
 
 		 1453 aa  155  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  29.61 
 
 		 2803 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  43.16 
 
 		 1537 aa  125  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  40 
 
 		 1538 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  41.91 
 
 		 2912 aa  102  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  35.94 
 
 		 1096 aa  100  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  42.65 
 
 		 2222 aa  99.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  35.68 
 
 		 499 aa  98.6  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  38.39 
 
 		 1611 aa  97.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  44.72 
 
 		 2178 aa  91.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  45.89 
 
 		 549 aa  90.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  44.44 
 
 		 577 aa  88.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  43.35 
 
 		 901 aa  87.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  35 
 
 		 827 aa  87  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  38.42 
 
 		 2192 aa  84.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  49.44 
 
 		 2002 aa  80.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  31.41 
 
 		 1284 aa  73.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  50.49 
 
 		 534 aa  71.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  28.09 
 
 		 1281 aa  70.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  37.39 
 
 		 1219 aa  70.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  30.32 
 
 		 1457 aa  68.6  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  27.37 
 
 		 1038 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  32.79 
 
 		 1047 aa  66.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  48.84 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 2170 aa  65.1  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  29.23 
 
 		 2402 aa  63.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  29.9 
 
 		 1438 aa  63.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  29.79 
 
 		 1379 aa  61.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  27.99 
 
 		 1916 aa  61.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  25.09 
 
 		 1017 aa  61.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  29.55 
 
 		 1143 aa  60.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1657 aa  60.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  30.99 
 
 		 680 aa  58.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  23.61 
 
 		 1018 aa  57  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  31.61 
 
 		 688 aa  57  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  34.91 
 
 		 482 aa  56.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  27.64 
 
 		 958 aa  55.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  27.8 
 
 		 958 aa  55.5  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  28.03 
 
 		 1454 aa  55.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  34.24 
 
 		 1887 aa  55.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.57 
 
 		 6885 aa  54.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  25.77 
 
 		 957 aa  53.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  39.78 
 
 		 743 aa  53.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  28.87 
 
 		 1143 aa  52.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  31.49 
 
 		 2207 aa  50.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  26.45 
 
 		 955 aa  50.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  25.43 
 
 		 1017 aa  49.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  26.95 
 
 		 2499 aa  49.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  26.75 
 
 		 711 aa  49.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  37.23 
 
 		 343 aa  48.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  27.07 
 
 		 902 aa  48.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.21 
 
 		 587 aa  48.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  23.67 
 
 		 1036 aa  47.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  24.55 
 
 		 247 aa  47  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  26.64 
 
 		 1645 aa  47  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  26.25 
 
 		 2026 aa  47  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  25.65 
 
 		 2081 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  32.89 
 
 		 373 aa  46.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1867  cytochrome c family protein  27.31 
 
 		 367 aa  46.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.189197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1837  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 344 aa  45.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0334665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  30.22 
 
 		 655 aa  45.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  30 
 
 		 655 aa  45.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>