184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0450 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0450  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 458 aa  929    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000189467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0531  rhodanese-like protein  56.75 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4123  Rhodanese domain protein  54.16 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2940  putative lipoprotein  45.4 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.133271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4032  lipoprotein, putative  42.03 
 
 		 467 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00291213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1205  rhodanese-like protein  34.01 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00418355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0444  rhodanese domain-containing protein  30.82 
 
 		 641 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  26.84 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  25.29 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  25.29 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  23.28 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  23.99 
 
 		 297 aa  72.8  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  26.42 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  27.04 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  25.34 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  29.69 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  24.92 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0072  Rhodanese domain protein  32.68 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.77875e-30 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  23.26 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  24.84 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  24.91 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  22.26 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  22.78 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  24.83 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  23.37 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  23.17 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  32.68 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000095367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  24.08 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  24.33 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  24.33 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  23.85 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  26.1 
 
 		 292 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  30.77 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  25.95 
 
 		 286 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  25.16 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.78 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  24.15 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  22.41 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  25.25 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  22.64 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  22.64 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  22.64 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  23.26 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  30.2 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3785  rhodanese-like protein  25.16 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  25.08 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  27.98 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  24.42 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  24.26 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  26.32 
 
 		 286 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  22.74 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  24.5 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  24.84 
 
 		 277 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  24.16 
 
 		 305 aa  57  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  23.57 
 
 		 314 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  23.39 
 
 		 281 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  27.42 
 
 		 288 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.48 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  23.67 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  23.76 
 
 		 286 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  23.73 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  23.73 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  23.73 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  23.59 
 
 		 277 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  22.74 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5900  rhodanese domain-containing protein  23.8 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  0.469982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  25 
 
 		 291 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.09 
 
 		 291 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2054  Rhodanese domain protein  28.4 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0105049  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  26.86 
 
 		 289 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  28.95 
 
 		 282 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  28.4 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  25.08 
 
 		 279 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  24.3 
 
 		 281 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  23.73 
 
 		 320 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  24.77 
 
 		 312 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  23.17 
 
 		 281 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  24.01 
 
 		 273 aa  54.3  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.91 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  27.52 
 
 		 275 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 		 331 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  22.68 
 
 		 281 aa  54.3  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  24.75 
 
 		 305 aa  54.3  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  29.14 
 
 		 277 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  25.16 
 
 		 301 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  26.3 
 
 		 284 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  24.88 
 
 		 289 aa  53.9  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  23.75 
 
 		 306 aa  53.9  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  24.59 
 
 		 282 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  26.09 
 
 		 282 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  25.52 
 
 		 282 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  25.32 
 
 		 282 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.52 
 
 		 282 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0560  Rhodanese domain protein  22.11 
 
 		 329 aa  53.5  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  26.74 
 
 		 277 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.09 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  23.08 
 
 		 307 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000021463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  23.08 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0689  rhodanese domain-containing protein  21.94 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.48 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>