More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0434 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 
228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  78.41 
 
 
227 aa  358  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  77.88 
 
 
228 aa  343  8.999999999999999e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  72.69 
 
 
228 aa  340  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  74.45 
 
 
228 aa  310  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  69.16 
 
 
228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  68.72 
 
 
228 aa  281  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.19 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  35.09 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.3 
 
 
223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.81 
 
 
235 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  33.92 
 
 
230 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.86 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.68 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.68 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.25 
 
 
249 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.4 
 
 
243 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.81 
 
 
244 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.75 
 
 
466 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.9 
 
 
253 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0323  cytochrome c biogenesis protein-like  37.35 
 
 
252 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.52 
 
 
246 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  31.41 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.52 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.88 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.88 
 
 
236 aa  95.9  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.19 
 
 
218 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2782  hypothetical protein  31.31 
 
 
235 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.1 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.19 
 
 
210 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.84 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  32.99 
 
 
237 aa  92  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  37.02 
 
 
471 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.11 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.23 
 
 
237 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  29.91 
 
 
403 aa  88.2  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  29.44 
 
 
403 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.07 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  37.71 
 
 
611 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  34.09 
 
 
623 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.28 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.75 
 
 
471 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.14 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.75 
 
 
471 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.67 
 
 
218 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.96 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  33.49 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.67 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  29.95 
 
 
586 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.26 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  29.95 
 
 
586 aa  78.6  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.27 
 
 
246 aa  79  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  32.76 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.9 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.8 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  34.41 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3668  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein, putative SoxV protein  30.24 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389509  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54791  biogenesis protein  26.69 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  31.51 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  31.03 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.61 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.54 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.82 
 
 
624 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.22 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.22 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.41 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  30.59 
 
 
449 aa  75.1  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1384  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.58 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0107253  normal  0.0935578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.91 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2005  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.43 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0109812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.03 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  33.15 
 
 
649 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.98 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.34 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  30.54 
 
 
608 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  32.34 
 
 
605 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1715  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  35.41 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0270352  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10432  predicted protein  30.41 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000896469  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.29 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  29.58 
 
 
396 aa  72.8  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  27.06 
 
 
449 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.95 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.128991  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.01 
 
 
247 aa  72  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1617  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.32 
 
 
244 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217228  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  29.41 
 
 
632 aa  72  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.73 
 
 
586 aa  72  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_557  cytochrome c biogenesis-type protein  32.57 
 
 
240 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.15 
 
 
626 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.16 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.11 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.37 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  30.88 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.05 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.41 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0753  putative cytochrome c-type biogenesis protein  28.31 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.117718  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  30.88 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.77 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.41 
 
 
449 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  28.64 
 
 
630 aa  68.2  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.85 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.800011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>