More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0364 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
170 aa  348  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.72 
 
 
174 aa  238  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.09 
 
 
174 aa  237  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  62.42 
 
 
171 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  59.39 
 
 
170 aa  216  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  47.62 
 
 
171 aa  184  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.17 
 
 
175 aa  160  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  37.14 
 
 
183 aa  111  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  34.81 
 
 
164 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  34.97 
 
 
179 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  42.34 
 
 
166 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  32.64 
 
 
176 aa  101  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  40.3 
 
 
171 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.3 
 
 
168 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.5 
 
 
169 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.4 
 
 
169 aa  97.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  34.67 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
390 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  30.12 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  34.62 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2789  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
376 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0340892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.59 
 
 
187 aa  94  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
174 aa  94  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  32 
 
 
180 aa  94  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  35.94 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.81 
 
 
178 aa  94  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  33.13 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 
155 aa  92.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.35 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  32.74 
 
 
172 aa  91.7  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  36.59 
 
 
168 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  30.43 
 
 
168 aa  91.3  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 
167 aa  90.9  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  35.83 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  34.68 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  36.07 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  31.45 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.94 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  35.84 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  31.45 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  34.68 
 
 
173 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  34.68 
 
 
173 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  34.68 
 
 
173 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  29.41 
 
 
172 aa  89  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  30.72 
 
 
165 aa  89  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  33.06 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  33.06 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  34.68 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  31.85 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  30.82 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  30.82 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  31.39 
 
 
184 aa  87.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  33.87 
 
 
173 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  34.72 
 
 
182 aa  87.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.08 
 
 
186 aa  87.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  30.63 
 
 
155 aa  87  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03915  putative thiol:disulfide interchange protein  33.09 
 
 
185 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.43 
 
 
288 aa  85.5  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  31.01 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  32.54 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  33.87 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  32.26 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  32.54 
 
 
182 aa  84.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.43 
 
 
189 aa  84.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  32.28 
 
 
155 aa  85.1  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  31.47 
 
 
160 aa  84.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2523  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
369 aa  84.3  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.434668  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  32.3 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  31.93 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  32.31 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  28.99 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  30.94 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  30.94 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  27.04 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.06 
 
 
409 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.5 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2528  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  34.15 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  30.07 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.07 
 
 
178 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  33.59 
 
 
403 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  33.59 
 
 
403 aa  82  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  29.93 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  34.78 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.49 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  35.54 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  27.49 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0469  redoxin domain-containing protein  33.04 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  33.05 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.45 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  30.28 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  34.51 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  31.2 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  32 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  36.67 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  31.94 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>