More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0290 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  100 
 
 		 151 aa  309  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  65.03 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  65.25 
 
 		 150 aa  190  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  63.57 
 
 		 149 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  64.79 
 
 		 149 aa  187  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  59.71 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  61.87 
 
 		 152 aa  184  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  63.58 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  63.58 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  60.99 
 
 		 149 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  56.64 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  60.99 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  55.8 
 
 		 152 aa  156  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  54.01 
 
 		 167 aa  153  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  50.34 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  51.75 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  47.95 
 
 		 162 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  51.75 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  47.52 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  49.65 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  49.65 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  47.26 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  49.65 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  50.35 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  50.35 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  50.74 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  51.06 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  47.59 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  50 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  46.48 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  48.55 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  51.77 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  44.93 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  48.91 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  47.33 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  46.32 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  48.12 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  44.52 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  44.52 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  45 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  49.28 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  43.17 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  45.14 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  42.75 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  44.6 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  42.96 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  40 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  48.06 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  39.86 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  43.57 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  41.73 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.17 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  37.58 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  42.55 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  46.04 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  41.01 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  40.56 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  43.17 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  42.36 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  42.14 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  39.16 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  41.43 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  41.43 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  41.43 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  41.43 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  41.43 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  41.43 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  41.43 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  46.27 
 
 		 129 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>