More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0271 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  83.45 
 
 		 417 aa  675    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  826    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  66.67 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  65.95 
 
 		 415 aa  498  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  62.01 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  52.3 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 445 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 412 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 392 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  29.19 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 434 aa  136  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  27.14 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  27.14 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  29.56 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  27.69 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  27.06 
 
 		 443 aa  122  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  27.06 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  26.63 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  28.24 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  28.62 
 
 		 437 aa  117  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  28.62 
 
 		 437 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  26.76 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  28.53 
 
 		 493 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.61 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.34 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  24.64 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  24.82 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  24.82 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  26.41 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.52 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 415 aa  110  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  22.97 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  22.97 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  28.92 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.54 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  26.26 
 
 		 412 aa  106  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.28 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  27.39 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  22.72 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  23.1 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  28.14 
 
 		 461 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  23.48 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  35.87 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  26.18 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  25.94 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  25.94 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 450 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  25.54 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 420 aa  98.2  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  25 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  28.34 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 447 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  25.65 
 
 		 447 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 436 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 428 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>