227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0266 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
306 aa  621  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  70.59 
 
 
306 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  41.72 
 
 
307 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  40.17 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 
312 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  37.19 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  34.66 
 
 
308 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
333 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.8 
 
 
316 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 
305 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
296 aa  124  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  39.07 
 
 
322 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  37.29 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  30.26 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 
308 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 
318 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  34.73 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.26 
 
 
312 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  32.36 
 
 
304 aa  116  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  35.61 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  33.79 
 
 
310 aa  109  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  35.05 
 
 
307 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 
302 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 
266 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 
328 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 
361 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  33.8 
 
 
327 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 
267 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
264 aa  107  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  30.8 
 
 
320 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
259 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
310 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 
307 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 
298 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  33.66 
 
 
330 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 
319 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
306 aa  99  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  30.03 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  31.7 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 
267 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  34.73 
 
 
325 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  33 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  27.1 
 
 
323 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  34.18 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  27.84 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  27.32 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  26.8 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  26.8 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  26.8 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
214 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.85 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 
212 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  41.67 
 
 
257 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  36.23 
 
 
284 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  31.41 
 
 
239 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  43.86 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
214 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 
205 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0078  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
215 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
214 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 
207 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 
209 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  28.29 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.71 
 
 
254 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  31.13 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 
329 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 
281 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0657  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 
207 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  28.85 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
214 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  29.94 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  31.47 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>