49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0236 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 103 aa  214  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  38.14 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  37 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  34 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  35.48 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  34.86 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  36.89 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  44.93 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  40.85 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  33.71 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  32.11 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  50.7 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  34.34 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  34 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  28.85 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  32.04 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  36.73 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  45.1 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  29.81 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  28.43 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  31.37 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  30.53 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  27.45 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  32.22 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  41.79 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  28.28 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  29.29 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  28.43 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  29.29 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  29.29 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  29.29 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3062  DNA polymerase, beta-like region  35.23 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  37.04 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  34.02 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 119 aa  42  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  30.77 
 
 		 110 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  30.12 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  26.47 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  28 
 
 		 134 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>