More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0210 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 199 aa  406  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  64.1 
 
 		 186 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  63.45 
 
 		 188 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  63.82 
 
 		 200 aa  230  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  63.28 
 
 		 181 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  55.15 
 
 		 190 aa  218  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  64.77 
 
 		 189 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  57.14 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  41.15 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  46 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  43.59 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  44.94 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  44.3 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  42.33 
 
 		 184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  42.31 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  44.25 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  41.24 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  41.24 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  41.24 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  41.24 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  41.24 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  41.24 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  41.24 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  46.97 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  41.24 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  42.68 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  36.27 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  46.97 
 
 		 192 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  42.11 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  46.97 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  47.01 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  39.1 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  36.21 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  39.77 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  42.11 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  42.58 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  43.04 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  40.57 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  43.04 
 
 		 187 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 189 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  43.04 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  42.07 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  39.78 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  45.93 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  41.14 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  38.64 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  40.25 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  40.54 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  40.67 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  39.39 
 
 		 190 aa  118  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  40.31 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  41.22 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  38.33 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  40 
 
 		 240 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  38.92 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  37.85 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  43.48 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  40.65 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  43.31 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  45.86 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  46.56 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.13 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  38.95 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  37.2 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  37.11 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  38.92 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  36.41 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  39.63 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  39.18 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  39.89 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  39.89 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.33 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  38.85 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  39.78 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  41.86 
 
 		 242 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  38.57 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  39.33 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  38.07 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  39.77 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>