More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0171 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0171  ATPase  100 
 
 
272 aa  550  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0037  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  90.07 
 
 
272 aa  500  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0036  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  90.07 
 
 
272 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0967142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0021  ATPase associated with various cellular activities  89.67 
 
 
272 aa  492  1e-138  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.954404  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3309  hypothetical protein  88.24 
 
 
272 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00793915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2642  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  81.99 
 
 
272 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1102  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.44 
 
 
281 aa  345  5e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.86062e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3634  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.97 
 
 
340 aa  312  5e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  30.62 
 
 
264 aa  72  9e-12  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  27.27 
 
 
350 aa  68.9  9e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3075  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.78 
 
 
372 aa  67.8  2e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0611881  decreased coverage  3.72935e-08 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  32.45 
 
 
315 aa  67  3e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.83 
 
 
334 aa  65.5  8e-10  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.67 
 
 
351 aa  65.1  1e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.5 
 
 
302 aa  65.1  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  32.24 
 
 
305 aa  64.7  2e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  30.77 
 
 
333 aa  64.3  2e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1205  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.14 
 
 
343 aa  64.3  2e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  28.1 
 
 
302 aa  63.9  2e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.63 
 
 
342 aa  63.9  3e-09  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  28.43 
 
 
328 aa  62.4  7e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.54 
 
 
335 aa  62.4  8e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  27 
 
 
302 aa  62.4  8e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.89 
 
 
334 aa  61.6  1e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  28.5 
 
 
331 aa  61.6  1e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4249  ATPase  28.76 
 
 
323 aa  61.6  1e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.86 
 
 
326 aa  61.6  1e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0659  ATPase  26.79 
 
 
341 aa  61.6  1e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.936381 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.96 
 
 
331 aa  62  1e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  27.14 
 
 
350 aa  60.8  2e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.05 
 
 
362 aa  60.8  2e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.942326 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  26.88 
 
 
338 aa  60.8  2e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  27.57 
 
 
340 aa  60.8  2e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  37.29 
 
 
260 aa  60.8  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  26.88 
 
 
338 aa  60.8  2e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0535  ATPase  28.64 
 
 
313 aa  61.2  2e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  7.89925e-05  normal  0.392501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  33.63 
 
 
270 aa  60.5  3e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.18 
 
 
341 aa  60.5  3e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  25.7 
 
 
303 aa  60.5  3e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  26.7 
 
 
305 aa  60.5  3e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  29.73 
 
 
302 aa  60.1  4e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.75 
 
 
327 aa  60.1  4e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3573  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.8 
 
 
340 aa  60.1  4e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  32.67 
 
 
306 aa  59.7  5e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  26.64 
 
 
309 aa  59.7  5e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  4.6022e-07 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  28.57 
 
 
333 aa  59.3  6e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  29.35 
 
 
298 aa  59.3  7e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  31.47 
 
 
343 aa  58.9  7e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  25.7 
 
 
303 aa  59.3  7e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.45 
 
 
320 aa  58.9  8e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  27.07 
 
 
337 aa  58.9  8e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1911  ATPase  28.86 
 
 
356 aa  58.9  9e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  30.04 
 
 
302 aa  58.9  9e-08  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.74 
 
 
306 aa  58.5  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  26.89 
 
 
305 aa  58.2  1e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  25.87 
 
 
332 aa  58.2  1e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  26.89 
 
 
305 aa  58.2  1e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  29.8 
 
 
347 aa  58.5  1e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.13 
 
 
329 aa  58.2  1e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  8.42987e-09 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  29.41 
 
 
346 aa  58.2  1e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  28.71 
 
 
324 aa  58.2  1e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  3.06223e-06  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.74 
 
 
306 aa  58.5  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  30.2 
 
 
315 aa  58.5  1e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.98 
 
 
332 aa  58.5  1e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.2 
 
 
332 aa  57.8  2e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  27.57 
 
 
309 aa  57.4  2e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  26.7 
 
 
305 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.73 
 
 
354 aa  57.4  2e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  24.76 
 
 
359 aa  57.8  2e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  28.89 
 
 
362 aa  57.4  2e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  29.44 
 
 
356 aa  57.4  2e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.24 
 
 
327 aa  57.8  2e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  30.87 
 
 
314 aa  57.8  2e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  24.52 
 
 
324 aa  57  3e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.92 
 
 
309 aa  57.4  3e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  32.89 
 
 
306 aa  57  3e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  28.86 
 
 
303 aa  57.4  3e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  28.02 
 
 
331 aa  57  3e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30 
 
 
295 aa  57.4  3e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  28.38 
 
 
312 aa  57  3e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  29.8 
 
 
313 aa  56.6  4e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.37 
 
 
266 aa  56.6  4e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  24.64 
 
 
325 aa  56.6  4e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2273  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.43 
 
 
323 aa  56.6  4e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  30.99 
 
 
334 aa  56.6  4e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  29.12 
 
 
316 aa  56.6  4e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.88 
 
 
356 aa  56.6  4e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.57 
 
 
306 aa  56.2  5e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  26.34 
 
 
338 aa  56.2  5e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.66 
 
 
313 aa  56.2  5e-07  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  33.57 
 
 
306 aa  56.2  5e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  29.8 
 
 
303 aa  56.2  5e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.73 
 
 
330 aa  56.6  5e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  29.81 
 
 
303 aa  56.2  5e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.27 
 
 
344 aa  56.6  5e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  29.8 
 
 
303 aa  56.2  6e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  30.2 
 
 
315 aa  56.2  6e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6734  ATPase  29.58 
 
 
385 aa  56.2  6e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140161  normal  0.0815898 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  33.9 
 
 
4917 aa  55.8  6e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.82 
 
 
308 aa  56.2  6e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>