More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0160 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  70.62 
 
 
592 aa  841  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  71.59 
 
 
602 aa  899  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  72.4 
 
 
603 aa  905  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  100 
 
 
616 aa  1231  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  62.58 
 
 
625 aa  767  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  75.57 
 
 
602 aa  916  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  58.09 
 
 
621 aa  657  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  45.59 
 
 
594 aa  564  1e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  44.23 
 
 
622 aa  529  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  43.14 
 
 
611 aa  523  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  3.1667e-08  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  44.37 
 
 
600 aa  519  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  43.11 
 
 
619 aa  516  1e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  42.23 
 
 
613 aa  514  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  42.17 
 
 
611 aa  514  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  43.17 
 
 
608 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  41.46 
 
 
614 aa  508  1e-142  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  41 
 
 
603 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  41.49 
 
 
600 aa  503  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  44.16 
 
 
611 aa  485  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
642 aa  485  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  43.09 
 
 
592 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  38.85 
 
 
586 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  40.66 
 
 
635 aa  476  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  39.7 
 
 
591 aa  472  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  42.88 
 
 
610 aa  464  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  38.68 
 
 
590 aa  459  1e-128  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
607 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  38.98 
 
 
588 aa  454  1e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  38.39 
 
 
587 aa  454  1e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  37.99 
 
 
588 aa  451  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.01252e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  36.45 
 
 
589 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  38.06 
 
 
588 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  42.11 
 
 
588 aa  435  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.81 
 
 
597 aa  432  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  41.24 
 
 
608 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  41.83 
 
 
650 aa  425  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  37.05 
 
 
594 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  39.54 
 
 
610 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  39.54 
 
 
610 aa  419  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  38.35 
 
 
602 aa  416  1e-115  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  35.97 
 
 
584 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  38.29 
 
 
623 aa  413  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  35.64 
 
 
586 aa  413  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  37.46 
 
 
610 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  38.92 
 
 
617 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  38.13 
 
 
603 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  2.45046e-06  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  37.27 
 
 
609 aa  405  1e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  40.99 
 
 
626 aa  409  1e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 
587 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 
587 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.47455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.01 
 
 
587 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  35.85 
 
 
587 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  35.05 
 
 
587 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  35.05 
 
 
587 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.85 
 
 
587 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  39.64 
 
 
598 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.26 
 
 
614 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.85 
 
 
587 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  35.18 
 
 
587 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.85 
 
 
587 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06018e-05 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.45 
 
 
598 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  37.89 
 
 
626 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  35.05 
 
 
587 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  36.17 
 
 
592 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  37.04 
 
 
585 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.24 
 
 
608 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  41.23 
 
 
622 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  35.62 
 
 
592 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  38.36 
 
 
637 aa  392  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  35.47 
 
 
597 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  37.84 
 
 
592 aa  389  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  37.58 
 
 
606 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  34.83 
 
 
578 aa  382  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  36 
 
 
599 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.66 
 
 
589 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.52 
 
 
609 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  37.48 
 
 
675 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  37.46 
 
 
632 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  37.38 
 
 
632 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.11 
 
 
594 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  41.21 
 
 
636 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
620 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.28 
 
 
617 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.00526e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  38.51 
 
 
600 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.83 
 
 
594 aa  372  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3126  ABC transporter related  42.2 
 
 
592 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  35.99 
 
 
645 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  36.8 
 
 
579 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  36.8 
 
 
579 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.84481e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  35.33 
 
 
602 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.05 
 
 
666 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  38.3 
 
 
598 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.27 
 
 
625 aa  365  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  35.2 
 
 
614 aa  363  5e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  34.96 
 
 
576 aa  363  7e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  38.11 
 
 
598 aa  363  7e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.51 
 
 
666 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  35.39 
 
 
666 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.39 
 
 
666 aa  361  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.39 
 
 
666 aa  360  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>