More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0152 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  49.16 
 
 
708 aa  678    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  57.18 
 
 
714 aa  842    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  54.61 
 
 
717 aa  783    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  79.44 
 
 
711 aa  1202    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  79.3 
 
 
711 aa  1199    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  54.18 
 
 
730 aa  782    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  100 
 
 
711 aa  1468    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  46.99 
 
 
710 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  80.7 
 
 
712 aa  1225    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  44.06 
 
 
717 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  41.91 
 
 
717 aa  621  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  44.55 
 
 
716 aa  612  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  43.78 
 
 
712 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  43.4 
 
 
721 aa  611  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  43.84 
 
 
716 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  43.08 
 
 
713 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  40.82 
 
 
767 aa  519  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.96 
 
 
722 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  41.99 
 
 
470 aa  353  8e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  40.69 
 
 
470 aa  350  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  39.35 
 
 
473 aa  346  8.999999999999999e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  36.6 
 
 
470 aa  332  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  36.6 
 
 
470 aa  331  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  36.6 
 
 
470 aa  331  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  36.38 
 
 
470 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  40.19 
 
 
472 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  38.25 
 
 
481 aa  319  9e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  38.92 
 
 
489 aa  317  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  35.43 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  36.36 
 
 
469 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.46 
 
 
480 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 
469 aa  313  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  36.23 
 
 
469 aa  312  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.43 
 
 
470 aa  313  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  38.2 
 
 
479 aa  312  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  35.93 
 
 
470 aa  312  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  37.69 
 
 
475 aa  312  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  35.12 
 
 
480 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  37.66 
 
 
470 aa  307  5.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  34.57 
 
 
470 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  37.45 
 
 
475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.35 
 
 
470 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  37.26 
 
 
473 aa  303  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  34.35 
 
 
470 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  36.19 
 
 
476 aa  303  8.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  34.57 
 
 
470 aa  303  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.47 
 
 
463 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.35 
 
 
470 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.35 
 
 
470 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.14 
 
 
470 aa  301  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  35.82 
 
 
475 aa  301  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  35.51 
 
 
471 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  39.85 
 
 
456 aa  298  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  35.08 
 
 
471 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  35.44 
 
 
475 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  36.38 
 
 
476 aa  297  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  39.65 
 
 
486 aa  296  9e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  37.66 
 
 
475 aa  296  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  37.66 
 
 
475 aa  296  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  37.66 
 
 
475 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  36.21 
 
 
473 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  37.66 
 
 
475 aa  296  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  36.27 
 
 
475 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  37.66 
 
 
475 aa  296  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  37.89 
 
 
475 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  37.66 
 
 
475 aa  296  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  37.66 
 
 
475 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  37.84 
 
 
478 aa  295  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  39.36 
 
 
465 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  36.91 
 
 
475 aa  294  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  37.61 
 
 
496 aa  294  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  35.29 
 
 
490 aa  295  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  37.98 
 
 
471 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  36.7 
 
 
475 aa  295  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  35.21 
 
 
522 aa  294  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  35.16 
 
 
472 aa  293  8e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  38.21 
 
 
482 aa  293  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  38.22 
 
 
481 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  35.21 
 
 
479 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  36.99 
 
 
481 aa  292  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  36.68 
 
 
476 aa  291  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  39.62 
 
 
458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  39.16 
 
 
477 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  36.99 
 
 
481 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.4 
 
 
536 aa  290  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  37.56 
 
 
463 aa  290  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  37.26 
 
 
493 aa  290  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  36.05 
 
 
474 aa  290  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  37.4 
 
 
483 aa  290  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.4 
 
 
483 aa  290  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.4 
 
 
483 aa  290  8e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  37.4 
 
 
483 aa  290  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  37.4 
 
 
483 aa  290  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  37.11 
 
 
481 aa  290  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  38.32 
 
 
486 aa  289  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  37.5 
 
 
475 aa  289  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  36.06 
 
 
477 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  36.08 
 
 
458 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  37.8 
 
 
481 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  35.86 
 
 
493 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>