19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0123 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0123  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00112268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0102  hypothetical protein  62.7 
 
 
184 aa  241  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000238688  normal  0.914343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0075  hypothetical protein  56.76 
 
 
185 aa  225  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.95667e-36 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0092  hypothetical protein  57.22 
 
 
186 aa  223  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0068181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0272  hypothetical protein  55.56 
 
 
181 aa  218  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0701  hypothetical protein  48.63 
 
 
189 aa  187  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.154886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0500  hypothetical protein  42.54 
 
 
205 aa  168  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000708354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2935  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.23691e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0016  hypothetical protein  27.72 
 
 
237 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0015  hypothetical protein  27.31 
 
 
248 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0015  hypothetical protein  27.1 
 
 
246 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0015  hypothetical protein  26.32 
 
 
241 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0352  hypothetical protein  34.09 
 
 
360 aa  64.7  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0269  hypothetical protein  25 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403479  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1904  hypothetical protein  31.15 
 
 
559 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3424  hypothetical protein  29.51 
 
 
543 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.163574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3343  hypothetical protein  29.51 
 
 
541 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3488  hypothetical protein  29.51 
 
 
543 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3409  hypothetical protein  32.79 
 
 
545 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0767793  normal  0.404004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>