82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0098 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0098  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000192012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  32.88 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.11 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  27.15 
 
 
664 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  27.15 
 
 
233 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  26.71 
 
 
349 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  26.03 
 
 
348 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  26.03 
 
 
349 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  26.44 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  23.33 
 
 
390 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  24.46 
 
 
354 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 
339 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  27.22 
 
 
616 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  27.78 
 
 
671 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  26.44 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 
671 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  22.73 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  24.56 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 
288 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  25.68 
 
 
671 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  27.69 
 
 
209 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 
220 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  24.29 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  23.66 
 
 
237 aa  48.5  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  23.4 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  23.91 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  22.89 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  21.76 
 
 
219 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  26.47 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  21.76 
 
 
217 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  24.66 
 
 
624 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  24.48 
 
 
229 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 
220 aa  47  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  23.08 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  23.08 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  21.76 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  23.08 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  21.76 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  24 
 
 
307 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  24.29 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  22.1 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  30.49 
 
 
553 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  24.81 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  21.18 
 
 
219 aa  45.1  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  25.62 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 
188 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  24.03 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  24.03 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  26.36 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  29.11 
 
 
275 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  24.03 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  29.81 
 
 
600 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  22.49 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  24.04 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 
313 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  25.71 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  22.6 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  20 
 
 
174 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  25 
 
 
223 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  23.66 
 
 
235 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  19.29 
 
 
398 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  23.21 
 
 
218 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
185 aa  42  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  23.08 
 
 
221 aa  42.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  22.51 
 
 
214 aa  42.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  23.46 
 
 
247 aa  42  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 
229 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  42.22 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>