129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0080 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0080  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
143 aa  283  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3641  heavy metal transport/detoxification protein  77.6 
 
 
158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  50.35 
 
 
142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1095  Heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 
138 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3167  Heavy metal transport/detoxification protein  59.18 
 
 
138 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1338  heavy metal-binding domain-containing protein  56.99 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  38.02 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  32.94 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
849 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
71 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  38.46 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  39.34 
 
 
67 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  40 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  45.9 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
938 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  32.81 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
885 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  32.81 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
805 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
805 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
805 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
891 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
760 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0206  Heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
69 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  36.07 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  35.82 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  35.71 
 
 
345 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  40 
 
 
803 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  36.07 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  37.7 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
826 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
806 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
811 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
806 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
811 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  38.1 
 
 
209 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
806 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
868 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  35 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
826 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  35.38 
 
 
833 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  29.69 
 
 
835 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
734 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  30.14 
 
 
837 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
887 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  38.57 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
837 aa  42.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  32.14 
 
 
837 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  32.79 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 
817 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  31.67 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  28.57 
 
 
954 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  33.93 
 
 
942 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
838 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
758 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
1071 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  34.48 
 
 
1196 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  31.25 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  32.39 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  39.29 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  35 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  31.08 
 
 
976 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  27.08 
 
 
926 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
866 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  37.5 
 
 
1182 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  29.03 
 
 
68 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  31.43 
 
 
824 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  26.23 
 
 
823 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 
801 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  30.65 
 
 
861 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
836 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  33 
 
 
97 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  33.67 
 
 
97 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  28.4 
 
 
743 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  27.87 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
797 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
818 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  30.3 
 
 
798 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  34.43 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  33.87 
 
 
742 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2405  heavy metal transport/detoxification protein  23.81 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  30.43 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  31.67 
 
 
709 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  30.3 
 
 
798 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>