More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0079 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
320 aa  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  78.06 
 
 
320 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1560  metal dependent phosphohydrolase  58.12 
 
 
317 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  54.45 
 
 
357 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  54.45 
 
 
357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  54.45 
 
 
357 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  53.93 
 
 
357 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  50.72 
 
 
1171 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.03 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.15 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  49.74 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  48.53 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  48.02 
 
 
350 aa  195  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  51.78 
 
 
740 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  53.16 
 
 
649 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  46.7 
 
 
308 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  49.75 
 
 
650 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
619 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.15 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  46.38 
 
 
1335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  49.74 
 
 
1237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  47.42 
 
 
212 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.6 
 
 
394 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50.26 
 
 
367 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.15 
 
 
351 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 
347 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1136  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  46.6 
 
 
391 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.6 
 
 
375 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3638  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
252 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  41.08 
 
 
1333 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1265  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.6 
 
 
375 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  46.23 
 
 
793 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  48.65 
 
 
1313 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.37 
 
 
345 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  45.13 
 
 
444 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
487 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 
438 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  46.07 
 
 
792 aa  166  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  37.04 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  37.04 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  37.04 
 
 
373 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  37.04 
 
 
373 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  37.04 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 
471 aa  165  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  45 
 
 
841 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  45.51 
 
 
836 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  36.76 
 
 
563 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3561  metal dependent phosphohydrolase  45.3 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.878767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  36.16 
 
 
374 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1237  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
286 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.71 
 
 
331 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  41.11 
 
 
465 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  41.24 
 
 
339 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
960 aa  162  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  41.12 
 
 
509 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  37.56 
 
 
564 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 
424 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.86 
 
 
491 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  42.08 
 
 
369 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.08 
 
 
369 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
463 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  40.89 
 
 
268 aa  159  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  35.76 
 
 
331 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 
469 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.56 
 
 
353 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  46.52 
 
 
547 aa  159  7e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1613  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42 
 
 
487 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350204  hitchhiker  0.000130728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.91 
 
 
350 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 
420 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.53 
 
 
346 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.18 
 
 
345 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 
545 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.08 
 
 
378 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  43.22 
 
 
356 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.5 
 
 
331 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.19 
 
 
347 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 
353 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 
718 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
719 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.79 
 
 
506 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 
553 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  37.63 
 
 
326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 
351 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  42.54 
 
 
428 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  41.55 
 
 
442 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  44.79 
 
 
539 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
1073 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 
306 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  45.76 
 
 
719 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.24 
 
 
498 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  43.85 
 
 
861 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1387  HD domain-containing protein  38.32 
 
 
422 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.09 
 
 
880 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 
363 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 
345 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 
619 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.09 
 
 
860 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  41.83 
 
 
512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1281  metal dependent phosphohydrolase  37.56 
 
 
421 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.246487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2248  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.43 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>