67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0077 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  100 
 
 
2499 aa  5062    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  38.84 
 
 
1438 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0521  cytochrome C family protein  75.49 
 
 
383 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  39.9 
 
 
869 aa  397  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  41 
 
 
1127 aa  374  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  29.39 
 
 
2026 aa  370  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  39.53 
 
 
979 aa  360  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  30.67 
 
 
1457 aa  348  8.999999999999999e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  32.28 
 
 
1611 aa  300  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  38.37 
 
 
1379 aa  284  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  28.66 
 
 
2222 aa  246  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  35.24 
 
 
901 aa  213  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  29.69 
 
 
1276 aa  211  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  35.08 
 
 
939 aa  202  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  34.06 
 
 
1196 aa  188  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  32.38 
 
 
1454 aa  174  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  31.46 
 
 
1453 aa  165  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  24.93 
 
 
1596 aa  159  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  36.21 
 
 
2803 aa  158  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  26.34 
 
 
1143 aa  140  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  28.01 
 
 
1521 aa  137  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  25.77 
 
 
1143 aa  134  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  24.71 
 
 
2912 aa  132  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  25.15 
 
 
902 aa  123  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  43.58 
 
 
1284 aa  117  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  28.54 
 
 
1672 aa  113  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  23.85 
 
 
1916 aa  111  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 
2178 aa  106  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  27.26 
 
 
1281 aa  105  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  26.05 
 
 
672 aa  105  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  29.71 
 
 
1691 aa  100  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  28.31 
 
 
1848 aa  99  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  25.46 
 
 
2081 aa  96.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  26.23 
 
 
688 aa  95.5  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  26.77 
 
 
958 aa  93.2  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  26.77 
 
 
958 aa  92.8  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  24.93 
 
 
1017 aa  88.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  26.27 
 
 
955 aa  87  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  23.22 
 
 
1525 aa  85.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  30.29 
 
 
1036 aa  85.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  31 
 
 
1537 aa  79.7  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  29.71 
 
 
1538 aa  79.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  23.16 
 
 
1018 aa  79.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  25.99 
 
 
957 aa  76.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  24.5 
 
 
1053 aa  75.9  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  27.06 
 
 
563 aa  76.3  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  25.78 
 
 
1009 aa  75.9  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  23.75 
 
 
1330 aa  75.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  24.03 
 
 
655 aa  72  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  27.73 
 
 
1017 aa  71.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  26.44 
 
 
1046 aa  71.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  22.9 
 
 
1329 aa  70.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  28.7 
 
 
1294 aa  70.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  23.88 
 
 
655 aa  69.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  22.76 
 
 
1329 aa  68.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  23.38 
 
 
655 aa  65.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  25.72 
 
 
1038 aa  63.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  23.57 
 
 
431 aa  58.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  25 
 
 
457 aa  54.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  28.68 
 
 
455 aa  53.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  29.41 
 
 
455 aa  52.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  33.78 
 
 
1496 aa  52.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  23.96 
 
 
616 aa  51.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  23.33 
 
 
656 aa  51.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  24.14 
 
 
616 aa  50.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  24.38 
 
 
1289 aa  50.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  25.13 
 
 
1645 aa  48.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>