69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0075 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  100 
 
 		 2222 aa  4497    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  55 
 
 		 1438 aa  1167    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  35.93 
 
 		 1276 aa  473  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  30.19 
 
 		 2026 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  32.05 
 
 		 979 aa  324  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  31.93 
 
 		 1457 aa  295  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  30.51 
 
 		 1454 aa  285  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  30.07 
 
 		 1453 aa  277  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  27.36 
 
 		 2803 aa  265  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  29.65 
 
 		 1127 aa  254  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  26.95 
 
 		 1379 aa  245  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  29.6 
 
 		 1916 aa  242  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  34.34 
 
 		 2912 aa  239  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  28.1 
 
 		 2499 aa  237  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  37.05 
 
 		 958 aa  229  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  37.05 
 
 		 958 aa  228  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  29.59 
 
 		 1143 aa  228  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  33.16 
 
 		 939 aa  226  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  35.92 
 
 		 957 aa  224  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  31.32 
 
 		 955 aa  221  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  31.58 
 
 		 869 aa  219  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  30.33 
 
 		 1143 aa  218  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  30.67 
 
 		 902 aa  177  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  22.39 
 
 		 2081 aa  176  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  32.33 
 
 		 688 aa  162  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0521  cytochrome C family protein  33.51 
 
 		 383 aa  160  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  25.45 
 
 		 1281 aa  151  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  25.2 
 
 		 1848 aa  139  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  32.92 
 
 		 901 aa  136  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  27.89 
 
 		 1691 aa  129  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  29.11 
 
 		 1611 aa  125  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  30.72 
 
 		 1596 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  28.87 
 
 		 1672 aa  122  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  25.6 
 
 		 672 aa  112  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  42.65 
 
 		 1496 aa  99.8  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  23.36 
 
 		 1330 aa  99.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  27.8 
 
 		 1009 aa  94.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  29.21 
 
 		 1036 aa  94.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  22.67 
 
 		 1645 aa  93.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  29.69 
 
 		 1046 aa  92  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  23.21 
 
 		 1329 aa  91.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  23.87 
 
 		 1525 aa  90.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  24.09 
 
 		 563 aa  88.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  25.28 
 
 		 1521 aa  87.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  25.26 
 
 		 1018 aa  87  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  27.63 
 
 		 431 aa  85.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  23.4 
 
 		 1329 aa  83.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  28.5 
 
 		 1017 aa  83.2  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  27.25 
 
 		 1196 aa  83.2  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  29.25 
 
 		 1017 aa  81.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  27.22 
 
 		 454 aa  77.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  24.86 
 
 		 655 aa  77.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  24.23 
 
 		 655 aa  75.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  25.31 
 
 		 655 aa  75.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  25.98 
 
 		 1053 aa  70.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  26.78 
 
 		 455 aa  68.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  27.78 
 
 		 457 aa  67.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  25.66 
 
 		 1038 aa  63.2  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1284 aa  61.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  26.07 
 
 		 455 aa  60.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2724  cytochrome c family protein  26.71 
 
 		 704 aa  58.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  27.53 
 
 		 336 aa  56.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1537 aa  54.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  23.36 
 
 		 656 aa  52.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1538 aa  51.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  26.5 
 
 		 2178 aa  47.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1157  hypothetical protein  27.81 
 
 		 642 aa  47.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1829  hypothetical protein  24.37 
 
 		 570 aa  47  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1289 aa  45.8  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>