12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0056 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 1750 aa  3595    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  31.14 
 
 		 3689 aa  373  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  29.77 
 
 		 1559 aa  277  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3992  hypothetical protein  30.62 
 
 		 1055 aa  244  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00061561  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0459  transglutaminase domain-containing protein  25.63 
 
 		 971 aa  152  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0449  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1096 aa  141  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.471029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2496  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1094 aa  140  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  30.8 
 
 		 2294 aa  110  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  23.26 
 
 		 1998 aa  94.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2668  hypothetical protein  27.08 
 
 		 123 aa  57.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00194257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2669  hypothetical protein  30.25 
 
 		 217 aa  51.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0544133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  22.11 
 
 		 3586 aa  47.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>