271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0052 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0052  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 276 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0781  extracellular solute-binding protein  46.39 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  41.95 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0648  extracellular solute-binding protein, family 1  38.02 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0661  extracellular solute-binding protein, family 1  38.15 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.81727e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3493  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 280 aa  188  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1735  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  32.95 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0647  extracellular solute-binding protein, family 1  35.34 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000964521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0660  extracellular solute-binding protein, family 1  34.82 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5102800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  32.39 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  29.77 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  29.72 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  30.14 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  29.34 
 
 		 283 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  27.27 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2484  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152963  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  26.67 
 
 		 278 aa  85.9  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  29.13 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  29.48 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  27.92 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  27.24 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  29.55 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  30.28 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  33.55 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  28.8 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.84 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  29.17 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  25.89 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  26.88 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2676  hypothetical protein  28 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.829729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  28.96 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  27.04 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  28.89 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  26.1 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.8 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  22.51 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  27.73 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.81 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  25.75 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  27.48 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.88 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  28.63 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  25.3 
 
 		 558 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  26.2 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  25.54 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  25.1 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  26.1 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  25 
 
 		 1035 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  25.3 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  29.17 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  23.91 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1692  phosphate-binding protein PstS-like protein  23.79 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  25.9 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  26.87 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1711  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  23.79 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  24.8 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  25.37 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  25.64 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.8 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  30.69 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  24.47 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  27.85 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  20.94 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  26.16 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  24.54 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  25.1 
 
 		 903 aa  66.2  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  25.82 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  24.05 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  27.97 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.95 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  26.4 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.11 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  24.63 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  23.53 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  23.53 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.53 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.53 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  23.53 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.53 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  25.8 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.53 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.53 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  25.4 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  27.27 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  22.8 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  26.39 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  26.14 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  25.54 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  23.53 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  25.23 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  23.7 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1794  phosphate-binding protein PstS-like protein  22.87 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  27.53 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  25.57 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  25.83 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  23.21 
 
 		 498 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  26.39 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  22.46 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>