19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0044 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0044  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  31.5 
 
 		 242 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  31.5 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1757  hypothetical protein  29.24 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.431367  normal  0.111889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1240  hypothetical protein  28.83 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2187  type IV pilus assembly PilZ  27.11 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1766  type IV pilus assembly PilZ  26.51 
 
 		 381 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3923  type IV pilus assembly PilZ  26.79 
 
 		 395 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  30.08 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0347  type IV pilus assembly PilZ  28.83 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.97543e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  26.76 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0366  type IV pilus assembly PilZ  27.74 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  27.31 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0717  type IV pilus assembly PilZ  24.82 
 
 		 331 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0730  type IV pilus assembly PilZ  23.36 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000601574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0320  type IV pilus assembly PilZ  23.66 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  32.58 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  31.03 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1109  hypothetical protein  21.03 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>