More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0043 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  100 
 
 
357 aa  716    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  64.51 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  62.43 
 
 
361 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  62.72 
 
 
370 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  63.02 
 
 
379 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  52.11 
 
 
358 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.98 
 
 
366 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.66 
 
 
360 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  39.83 
 
 
354 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  39.83 
 
 
354 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  43.26 
 
 
364 aa  261  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  42.98 
 
 
364 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  41.46 
 
 
375 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  42.7 
 
 
364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.69 
 
 
362 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  42.42 
 
 
364 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  42.42 
 
 
364 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  44.26 
 
 
852 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 
364 aa  249  7e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.31 
 
 
362 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  40.83 
 
 
864 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  35.64 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.59 
 
 
361 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  36.9 
 
 
863 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  38.46 
 
 
863 aa  216  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.46 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  36.84 
 
 
363 aa  212  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  30.81 
 
 
358 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.9 
 
 
352 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  30.81 
 
 
358 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  38.4 
 
 
357 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  38.27 
 
 
368 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  38.14 
 
 
368 aa  202  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  36.96 
 
 
366 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.61 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  37.85 
 
 
368 aa  199  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  37.85 
 
 
368 aa  199  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  38.8 
 
 
367 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.97 
 
 
359 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.74 
 
 
364 aa  196  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 
371 aa  195  9e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  32.62 
 
 
362 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  28.08 
 
 
371 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 
371 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  36.77 
 
 
368 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.59 
 
 
362 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  37.25 
 
 
346 aa  192  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.24 
 
 
498 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 
371 aa  189  9e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.28 
 
 
364 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  29.02 
 
 
371 aa  188  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  37.36 
 
 
350 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.97 
 
 
498 aa  186  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.6 
 
 
360 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.67 
 
 
496 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  31.61 
 
 
371 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  34.05 
 
 
378 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  36.83 
 
 
366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  42.62 
 
 
366 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  32.05 
 
 
360 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  29.43 
 
 
359 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  33.97 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.09 
 
 
372 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  34.72 
 
 
339 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.05 
 
 
332 aa  176  8e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.24 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  36.69 
 
 
858 aa  174  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.22 
 
 
348 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.88 
 
 
374 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.48 
 
 
356 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.85 
 
 
360 aa  166  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  32.03 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  32.68 
 
 
357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  34.09 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  29.23 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  29.81 
 
 
374 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.72 
 
 
356 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  35.71 
 
 
349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.6 
 
 
357 aa  162  9e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  32.04 
 
 
383 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  35.85 
 
 
357 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 
360 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  31.33 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  27.22 
 
 
361 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  35.86 
 
 
387 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  35.96 
 
 
332 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  29.26 
 
 
360 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  35.29 
 
 
354 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  32.58 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.29 
 
 
357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  30.99 
 
 
355 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  29.34 
 
 
342 aa  150  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  30.35 
 
 
370 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
366 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.07 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0101  aminotransferase  32.33 
 
 
331 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 
363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 
366 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>