More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0025 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0025  histidine kinase  100 
 
 		 147 aa  304  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000104347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  64.75 
 
 		 637 aa  167  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  60 
 
 		 484 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.54 
 
 		 482 aa  157  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  58.68 
 
 		 520 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.64 
 
 		 546 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 		 581 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.79 
 
 		 1021 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  43.7 
 
 		 581 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  46.67 
 
 		 613 aa  124  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 579 aa  122  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  51.33 
 
 		 613 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  51.33 
 
 		 613 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 		 619 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 609 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 614 aa  121  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  42.96 
 
 		 581 aa  121  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 581 aa  121  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.33 
 
 		 611 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  50.44 
 
 		 613 aa  121  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  50.44 
 
 		 613 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  50.44 
 
 		 613 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  50.44 
 
 		 613 aa  120  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  47.01 
 
 		 482 aa  121  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  50.44 
 
 		 613 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.78 
 
 		 556 aa  120  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  50.44 
 
 		 613 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 614 aa  121  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  50.44 
 
 		 613 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 		 641 aa  120  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 		 519 aa  120  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 592 aa  120  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 		 556 aa  120  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  45.16 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 613 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 701 aa  117  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 608 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.67 
 
 		 639 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  53.1 
 
 		 470 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.72 
 
 		 458 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  45.38 
 
 		 463 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 1042 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 		 534 aa  114  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 		 639 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 		 639 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 		 592 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  44.62 
 
 		 463 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 633 aa  114  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  45.16 
 
 		 463 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  43.08 
 
 		 462 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 621 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  43.85 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  43.85 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  43.85 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  43.85 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 1039 aa  111  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 456 aa  111  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 		 612 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 		 421 aa  111  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  42.74 
 
 		 473 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.33 
 
 		 933 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  43.08 
 
 		 337 aa  110  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 		 1043 aa  110  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 1026 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 418 aa  110  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  39.86 
 
 		 610 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  40.58 
 
 		 456 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 718 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 733 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 827 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 456 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 695 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 1629 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 885 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 		 503 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  43.85 
 
 		 463 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0074  histidine kinase  41.84 
 
 		 492 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 608 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 535 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.22 
 
 		 1274 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  39.86 
 
 		 608 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 503 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  47.86 
 
 		 425 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  43.41 
 
 		 356 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 607 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 383 aa  107  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  43.55 
 
 		 1046 aa  107  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 621 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 460 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 379 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  43.7 
 
 		 484 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 524 aa  107  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  43.7 
 
 		 484 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1715  histidine kinase  41.13 
 
 		 220 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 		 633 aa  107  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  45 
 
 		 410 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>