More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0013 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  77.29 
 
 		 251 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  77.29 
 
 		 251 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  68.53 
 
 		 251 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  68.62 
 
 		 239 aa  329  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  62.55 
 
 		 251 aa  315  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  27.89 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.44 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  29.44 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  25.69 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  25.69 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  28.16 
 
 		 279 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  28.98 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  28.88 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.17 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  28.98 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  27.24 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  28.28 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  27.13 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  28.57 
 
 		 277 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.72 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  28.02 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  28.29 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  26.39 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  28.98 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  28.57 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  28.57 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  27.67 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  27.85 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  27.85 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  27.85 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  27.85 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  28.23 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  27.85 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  26.53 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  28.23 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  28.23 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  28.23 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  28.23 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  28.23 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  28.23 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  28.23 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  28.15 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  28.45 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  28.57 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  26.56 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.57 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  26.7 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  27.78 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  26.21 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  26.98 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  27.37 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  27.18 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.9 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  28.16 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  26.32 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  26.63 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  29.44 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  26.63 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  27.37 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  25.82 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  29.13 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>