268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gs5SA on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  Gs5SA  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 112 bp  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs5SB  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 112 bp  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.271264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  97.27 
 
 		 117 bp  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  97.27 
 
 		 117 bp  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 117 bp  190  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 117 bp  190  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 117 bp  190  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 117 bp  190  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 132 bp  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 132 bp  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 115 bp  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 117 bp  143  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 115 bp  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 115 bp  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 117 bp  143  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 115 bp  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 117 bp  143  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 117 bp  143  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0005  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 117 bp  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.52738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0016  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 117 bp  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0048  5S ribosomal RNA  89.58 
 
 		 111 bp  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0053  5S ribosomal RNA  89.58 
 
 		 111 bp  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0282002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 117 bp  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10570  5S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 123 bp  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22200  5S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 123 bp  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.380551  normal  0.811083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06930  5S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 123 bp  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.648291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37120  5S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 123 bp  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  87.65 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  87.65 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0005  5S ribosomal RNA  89.39 
 
 		 115 bp  75.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0036  5S ribosomal RNA  89.39 
 
 		 115 bp  75.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0040  5S ribosomal RNA  89.39 
 
 		 115 bp  75.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.852672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  95.24 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  95.24 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0065  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0010  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.629957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0078  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000574865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0021  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000104076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0022  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0056  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0032  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000010425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5743  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5746  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5755  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5761  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5764  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5767  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 111 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000116151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5770  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 111 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000576243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-3  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-4  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000434423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-6  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-7  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-8  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-9  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000019949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r02  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.069713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000275902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000843494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000269738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SA  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SB  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SD  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SE  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.711544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SF  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.932076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SG  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0064  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0061  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0005  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0012  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0017  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000279658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0029  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.350698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>