More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5065 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  100 
 
 		 151 aa  294  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  59.31 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  61.64 
 
 		 148 aa  183  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  62.76 
 
 		 148 aa  182  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  60.54 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  60.54 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  63.19 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  57.24 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  58.62 
 
 		 148 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  59.73 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  58.33 
 
 		 148 aa  174  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  57.82 
 
 		 149 aa  173  9e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  60.69 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  56.55 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  58.22 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  57.43 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  59.18 
 
 		 151 aa  167  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  55.78 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  52.41 
 
 		 149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  55.03 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  53.74 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  54.36 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  52.32 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  49.66 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  52.98 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  56.55 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  52.03 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  51.7 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  53.79 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  46.26 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  49.33 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 170 aa  127  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 148 aa  126  8.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.45 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 147 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  37.32 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  41.96 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  44.78 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  40.85 
 
 		 191 aa  114  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 178 aa  112  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  36.11 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.44 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 189 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  47.41 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 209 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  43.24 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 193 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  40.15 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  42.38 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  42.38 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  42.38 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 188 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  42 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  42 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>