More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5040 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  67.27 
 
 		 507 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  100 
 
 		 502 aa  999    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  69.06 
 
 		 505 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  67.27 
 
 		 507 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  69.2 
 
 		 507 aa  672    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  65.38 
 
 		 522 aa  614  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  60.64 
 
 		 497 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  59.96 
 
 		 499 aa  588  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  61.2 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  56.05 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  58.43 
 
 		 500 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  58.75 
 
 		 499 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  59 
 
 		 505 aa  561  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  58.22 
 
 		 504 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  59.24 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  55.93 
 
 		 506 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  57.75 
 
 		 504 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  57.14 
 
 		 498 aa  558  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  57.46 
 
 		 504 aa  557  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  55.93 
 
 		 505 aa  553  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  59.56 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  54.46 
 
 		 514 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  56.63 
 
 		 504 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  53.2 
 
 		 505 aa  549  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  54.78 
 
 		 503 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  59.4 
 
 		 509 aa  548  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  55.76 
 
 		 498 aa  550  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  59.48 
 
 		 499 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  55.47 
 
 		 504 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  54.98 
 
 		 505 aa  547  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  54.84 
 
 		 499 aa  545  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  55.58 
 
 		 505 aa  541  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  56 
 
 		 499 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  54 
 
 		 505 aa  544  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5304  glycerol kinase  58.38 
 
 		 507 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  55.09 
 
 		 503 aa  541  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  60.08 
 
 		 501 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  53.83 
 
 		 504 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  57.11 
 
 		 510 aa  538  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  55.13 
 
 		 499 aa  537  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  60.04 
 
 		 501 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  50.8 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  59.68 
 
 		 501 aa  532  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  53.68 
 
 		 510 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  57.75 
 
 		 496 aa  530  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  54.02 
 
 		 520 aa  530  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  53.68 
 
 		 510 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  53.88 
 
 		 510 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  52.43 
 
 		 494 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  50.4 
 
 		 496 aa  528  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  50 
 
 		 498 aa  523  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  53.86 
 
 		 517 aa  525  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  55.49 
 
 		 506 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  57.56 
 
 		 514 aa  519  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  50.39 
 
 		 513 aa  521  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  53.41 
 
 		 496 aa  518  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  53.11 
 
 		 502 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  54.6 
 
 		 510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  51.36 
 
 		 513 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  52.89 
 
 		 507 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  48.7 
 
 		 497 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  54 
 
 		 505 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  54.69 
 
 		 505 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  54.2 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  52.89 
 
 		 498 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  50.89 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1472  glycerol kinase  51.85 
 
 		 510 aa  509  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  50.1 
 
 		 513 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  50.29 
 
 		 510 aa  508  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  49.8 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  49.2 
 
 		 505 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  49.6 
 
 		 500 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  49.4 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  50.39 
 
 		 527 aa  505  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  54.38 
 
 		 505 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  53.59 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  52.87 
 
 		 505 aa  501  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  48.3 
 
 		 496 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  47.9 
 
 		 494 aa  502  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  48.61 
 
 		 500 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  46.89 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  46.89 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  49 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  46.89 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  49 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  46.69 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  49.21 
 
 		 501 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  46.89 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21570  glycerol kinase  52 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  52.71 
 
 		 497 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  53.19 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  49 
 
 		 518 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  49 
 
 		 518 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  49 
 
 		 518 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  49 
 
 		 518 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  49 
 
 		 518 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  53.41 
 
 		 496 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  46.69 
 
 		 496 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  51.41 
 
 		 498 aa  497  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  48.41 
 
 		 500 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>