More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5008 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
546 aa  1046    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  53.93 
 
 
540 aa  458  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.5 
 
 
542 aa  435  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.56 
 
 
537 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.6 
 
 
538 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  57.04 
 
 
540 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  57.45 
 
 
518 aa  379  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  67.08 
 
 
543 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  67.92 
 
 
538 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.63 
 
 
536 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  47.63 
 
 
545 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  48.45 
 
 
542 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  50.52 
 
 
533 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.35 
 
 
528 aa  339  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.55 
 
 
545 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.59 
 
 
538 aa  332  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  60.42 
 
 
562 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.4 
 
 
523 aa  327  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.37 
 
 
538 aa  326  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  50.53 
 
 
531 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  63.17 
 
 
533 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.27 
 
 
522 aa  313  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  55.59 
 
 
407 aa  313  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.14 
 
 
623 aa  312  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.75 
 
 
547 aa  312  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  53.01 
 
 
530 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.43 
 
 
535 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.6 
 
 
538 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.71 
 
 
394 aa  301  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.59 
 
 
904 aa  297  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.72 
 
 
545 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  52.66 
 
 
540 aa  294  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.62 
 
 
544 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  47.52 
 
 
583 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.06 
 
 
532 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.07 
 
 
535 aa  279  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  49.57 
 
 
347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.71 
 
 
1150 aa  273  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.61 
 
 
858 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  54.75 
 
 
535 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.69 
 
 
544 aa  267  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  53.63 
 
 
540 aa  261  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.73 
 
 
545 aa  259  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.23 
 
 
535 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.16 
 
 
531 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.12 
 
 
550 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 
529 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.92 
 
 
702 aa  239  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.56 
 
 
538 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.76 
 
 
524 aa  236  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.31 
 
 
530 aa  235  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.47 
 
 
397 aa  231  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.31 
 
 
715 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.32 
 
 
526 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  56.17 
 
 
965 aa  225  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.08 
 
 
741 aa  223  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  47.98 
 
 
533 aa  221  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 
562 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 
563 aa  217  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 
539 aa  216  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.74 
 
 
573 aa  216  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 
566 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.3 
 
 
731 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.58 
 
 
493 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 
625 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 
672 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
515 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.05 
 
 
562 aa  212  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 
686 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 
730 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
565 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 
567 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 
730 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 
538 aa  209  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 
563 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 
566 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.55 
 
 
561 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  39.19 
 
 
688 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.59 
 
 
572 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
561 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 
667 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 
688 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  38.21 
 
 
561 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.86 
 
 
564 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 
561 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
673 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  38.74 
 
 
656 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.17 
 
 
554 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 
567 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
565 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 
670 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0191  chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 
565 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.39 
 
 
573 aa  200  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.2 
 
 
656 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.57 
 
 
650 aa  200  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  40.5 
 
 
697 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.52 
 
 
558 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 
563 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  37.79 
 
 
656 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.67 
 
 
675 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>