51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4955 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  100 
 
 		 366 aa  713    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  59.29 
 
 		 301 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  36.69 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  51.28 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  56.2 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  35.44 
 
 		 286 aa  136  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  69.52 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  57.69 
 
 		 299 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  52.54 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  48.96 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  50.34 
 
 		 273 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  43.05 
 
 		 158 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  45.19 
 
 		 291 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  45.79 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  43.14 
 
 		 301 aa  93.2  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  39.81 
 
 		 145 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  44.64 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  41.27 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  42.34 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  42.73 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  36.61 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  34.41 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  32.29 
 
 		 486 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  37.78 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  38.14 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  38.14 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  25.66 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  36.07 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  35.71 
 
 		 288 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  35.85 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  38.02 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  39.02 
 
 		 112 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3993  hypothetical protein  31.68 
 
 		 118 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0690307  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  37.4 
 
 		 305 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  35.96 
 
 		 311 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0070  hypothetical protein  31.33 
 
 		 263 aa  49.7  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  34.78 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  34.78 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  34.78 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  33 
 
 		 129 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  31.82 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  28.71 
 
 		 122 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  32.58 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  31.62 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24560  protein of unknown function (DUF2382)  46.15 
 
 		 160 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  25.87 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  30.61 
 
 		 160 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  33.71 
 
 		 268 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  31.73 
 
 		 259 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  31.73 
 
 		 259 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  32.08 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>