More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4881 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4881  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 320 aa  604  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2787  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.12 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4537  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.81 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262388  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4715  putative 2-nitropropane dioxygenase  41.27 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3202  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  40 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306208  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8517  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.54 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.24 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5156  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.19 
 
 		 317 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1242  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.86 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10021  hypothetical protein  41.43 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.06 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1082  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.41 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1215  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.9 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1232  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.9 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.86313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  34.16 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3841  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.8 
 
 		 506 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.5 
 
 		 492 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0206  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.57 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  32.26 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.89 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.91 
 
 		 315 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.92 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.66 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3191  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.06 
 
 		 492 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.94 
 
 		 492 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.2 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.7 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.81 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1141  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.84 
 
 		 338 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.487634  normal  0.166905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.96 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2480  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.52 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.41 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  29.69 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.71 
 
 		 383 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.65 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.37 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6053  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.22 
 
 		 341 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.94 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  31.79 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.07 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.07 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  37.71 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.35 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.59 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  32.85 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.03 
 
 		 378 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.55 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.48 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.03 
 
 		 329 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.14 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.4 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  30.98 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.94 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.9 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.39 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.89 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.23 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.23 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  30.06 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  30.31 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.88 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.55 
 
 		 374 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.55 
 
 		 374 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.66 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.1 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.66 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.55 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38755  predicted protein  32.31 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.172  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.51 
 
 		 366 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.8 
 
 		 376 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.4 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.49 
 
 		 376 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.46 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.46 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.61 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.22 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  39.92 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.72 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  30.2 
 
 		 359 aa  96.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.42 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.26 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.22 
 
 		 378 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.26 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.26 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.43 
 
 		 376 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.38 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.87 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.45 
 
 		 353 aa  95.9  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  34.16 
 
 		 376 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.56 
 
 		 355 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.61 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.56 
 
 		 355 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.39 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.78 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.27 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3305  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.8 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.51 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.91 
 
 		 354 aa  93.2  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>