More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4866 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  100 
 
 
350 aa  685    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  40.76 
 
 
335 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.8 
 
 
332 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  34.63 
 
 
340 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  32.93 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  32.04 
 
 
342 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  32.77 
 
 
372 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  32.96 
 
 
372 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  32.96 
 
 
372 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  28.62 
 
 
330 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  31.68 
 
 
337 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  32.7 
 
 
378 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.49 
 
 
337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  34.18 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  34.57 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  33.75 
 
 
345 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  34.94 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  29.43 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  32.97 
 
 
348 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  33.15 
 
 
363 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  31.2 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  30.46 
 
 
378 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  33.85 
 
 
348 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  29.81 
 
 
306 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  49.04 
 
 
331 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  33.98 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  33.07 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  33.44 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  50.96 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  33.46 
 
 
348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  32.52 
 
 
446 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  30 
 
 
366 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  31.87 
 
 
327 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  31.82 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  53.61 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  30.99 
 
 
350 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  52.48 
 
 
363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  32.27 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  52.08 
 
 
361 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  52.08 
 
 
361 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  50.5 
 
 
315 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  31.36 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
452 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.42 
 
 
235 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  45.92 
 
 
334 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  25.95 
 
 
333 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.36 
 
 
438 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.65 
 
 
531 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  49.47 
 
 
162 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  49.52 
 
 
501 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.83 
 
 
222 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  44.36 
 
 
347 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  30.38 
 
 
323 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
392 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  46.53 
 
 
391 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.6 
 
 
176 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  46.3 
 
 
517 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  27.38 
 
 
348 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  42.96 
 
 
175 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  50 
 
 
236 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  46.81 
 
 
217 aa  99.8  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.09 
 
 
393 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  45.13 
 
 
368 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  37.74 
 
 
467 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  31.58 
 
 
375 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  37.74 
 
 
467 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  29.11 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  47.42 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  50 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  42.65 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  40.44 
 
 
475 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  40.44 
 
 
475 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  40.44 
 
 
475 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.35 
 
 
232 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  51.11 
 
 
368 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  46.23 
 
 
281 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
265 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  25.94 
 
 
330 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  45.79 
 
 
400 aa  96.3  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  42.06 
 
 
472 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  37.74 
 
 
469 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  42.34 
 
 
204 aa  95.9  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  50 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  43.93 
 
 
432 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  38.24 
 
 
472 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  48.04 
 
 
319 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.92 
 
 
390 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.24 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.34 
 
 
476 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
479 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  39.52 
 
 
1048 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  44.76 
 
 
366 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  30.97 
 
 
301 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  47.92 
 
 
373 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  40 
 
 
478 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  35.85 
 
 
467 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  46.07 
 
 
293 aa  94  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  37.28 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  46.94 
 
 
349 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  36.48 
 
 
469 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>