More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4851 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 344 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  53.64 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  51.1 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  50.94 
 
 		 328 aa  269  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  56.78 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  56.78 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  56.78 
 
 		 325 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  49.84 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  49.85 
 
 		 332 aa  245  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  48.63 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  51.41 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  50 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  43.08 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  41.53 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  46.03 
 
 		 308 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  42.46 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  41.03 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  39.23 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  44.16 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  41.12 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  40.3 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  43.28 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  36.22 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  33.03 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  34.78 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  34.78 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  39.32 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  38.29 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  34.17 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  36.48 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  36.73 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  32.71 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  36.71 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  28.39 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  37.7 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  31.75 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  30.06 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  31.55 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  38.6 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  37.3 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  36.71 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  36.39 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  32.83 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  31.96 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  30.57 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  36.22 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.94 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  38.15 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  37.38 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  35.99 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  35.33 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  35.58 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  37.38 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  28.48 
 
 		 311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  33.86 
 
 		 318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  30.72 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  27.56 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  32.06 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  35.74 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  29.18 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  35.4 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  32.91 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  32.88 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  32.88 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  38.29 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.3 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  33.22 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  34.91 
 
 		 326 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  29.15 
 
 		 308 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  33.22 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  33.22 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  37.04 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  33.22 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  31.33 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  32.88 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  32.88 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  35.4 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  34.47 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  31.65 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  31.7 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  29.49 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>