74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4717 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 476 aa  933    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  67.82 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  67.67 
 
 		 468 aa  579  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  62.6 
 
 		 497 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  62.2 
 
 		 494 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  64.52 
 
 		 461 aa  552  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  64.09 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  59.31 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  55.81 
 
 		 764 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  56.33 
 
 		 759 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  60.67 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  62.44 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  60.19 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  59.15 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  54.55 
 
 		 453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  57.88 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  51.74 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  53.7 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  54.89 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  55.26 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  49.77 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  51.05 
 
 		 497 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  53.46 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  50.59 
 
 		 454 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  52.77 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  31.2 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.55 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.44 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.78 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.65 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.78 
 
 		 326 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  24.84 
 
 		 327 aa  57  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.07 
 
 		 326 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.48 
 
 		 326 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.94 
 
 		 326 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.77 
 
 		 377 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.12 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  23.66 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.66 
 
 		 326 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  23.66 
 
 		 326 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.24 
 
 		 331 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.95 
 
 		 358 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.77 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.66 
 
 		 326 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.66 
 
 		 326 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.71 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  22.69 
 
 		 330 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.38 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  27.47 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1047  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  20.47 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33924  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2182  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.56 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.05 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 513 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.62 
 
 		 361 aa  47  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12483  thioredoxin reductase  22.55 
 
 		 320 aa  47  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.93 
 
 		 527 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.07 
 
 		 378 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  30.09 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.74 
 
 		 352 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4060  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.75 
 
 		 334 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0593579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.06 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.29 
 
 		 348 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  51.28 
 
 		 496 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  30.25 
 
 		 427 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  59.52 
 
 		 528 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  52.5 
 
 		 480 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0615  cyclohexanone monooxygenase  30.89 
 
 		 489 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  46.81 
 
 		 534 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  32.43 
 
 		 329 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  55.26 
 
 		 519 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  50 
 
 		 367 aa  43.5  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  24.39 
 
 		 442 aa  43.5  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  24.62 
 
 		 480 aa  43.5  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>