More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4658 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 522 aa  1021    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  48.7 
 
 		 485 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 		 503 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 		 473 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 460 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 		 535 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.79 
 
 		 473 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.79 
 
 		 473 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.14 
 
 		 515 aa  336  5e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  46.71 
 
 		 487 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 		 468 aa  312  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  45.44 
 
 		 488 aa  309  8e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  42.77 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.47 
 
 		 479 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  43.9 
 
 		 496 aa  293  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 545 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  39.68 
 
 		 520 aa  289  8e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.01 
 
 		 528 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.14 
 
 		 500 aa  282  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 		 601 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  47.8 
 
 		 505 aa  279  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.13 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.95 
 
 		 524 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.86 
 
 		 486 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 529 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4063  histidine kinase  52 
 
 		 525 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  50.51 
 
 		 550 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 488 aa  259  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 635 aa  248  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  38.76 
 
 		 471 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 532 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3685  ATPase domain-containing protein  43.02 
 
 		 519 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 532 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  48.1 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 517 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.16 
 
 		 490 aa  240  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  37.6 
 
 		 470 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  49.17 
 
 		 467 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.84 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  38.87 
 
 		 506 aa  233  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  47.85 
 
 		 477 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  31.82 
 
 		 648 aa  231  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  39.29 
 
 		 540 aa  231  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.85 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  40.86 
 
 		 492 aa  223  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 		 365 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  35.1 
 
 		 559 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 		 546 aa  217  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  43.84 
 
 		 477 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 612 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 552 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 534 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  44.2 
 
 		 473 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  36.05 
 
 		 503 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  37.2 
 
 		 494 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  40.16 
 
 		 469 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 480 aa  193  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  36.96 
 
 		 494 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  33.72 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 502 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 510 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 504 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  35.95 
 
 		 477 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 526 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  38.48 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 509 aa  180  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  35.54 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.48 
 
 		 486 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 585 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 587 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  38.01 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  38.59 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  38.59 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 498 aa  170  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  38.59 
 
 		 587 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  35.95 
 
 		 481 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  38.59 
 
 		 587 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  38.59 
 
 		 587 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  38.59 
 
 		 587 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 459 aa  169  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  34.59 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 639 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  38.59 
 
 		 587 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  38.59 
 
 		 587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  38.59 
 
 		 587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 639 aa  167  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  39.52 
 
 		 469 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 600 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 459 aa  166  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.44 
 
 		 447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 607 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>