More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4657 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  73.71 
 
 		 233 aa  341  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  73.28 
 
 		 233 aa  340  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  72.05 
 
 		 235 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.17 
 
 		 244 aa  335  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  68.83 
 
 		 247 aa  325  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.08 
 
 		 243 aa  324  6e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.24 
 
 		 239 aa  324  6e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  68.83 
 
 		 239 aa  324  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  68.83 
 
 		 239 aa  324  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  68.83 
 
 		 239 aa  324  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  68.4 
 
 		 238 aa  323  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  72.49 
 
 		 234 aa  322  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  70.93 
 
 		 236 aa  321  5e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  71.74 
 
 		 234 aa  320  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  67.97 
 
 		 236 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.81 
 
 		 235 aa  319  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  62.87 
 
 		 241 aa  318  6e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.77 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  68.49 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.24 
 
 		 236 aa  314  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  66.23 
 
 		 238 aa  311  5.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.66 
 
 		 236 aa  310  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  68.1 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  65.95 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  63.48 
 
 		 239 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.37 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.13 
 
 		 236 aa  295  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  62.39 
 
 		 246 aa  295  6e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  59.58 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  61.95 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  63 
 
 		 229 aa  284  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  56.67 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.79 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  61.43 
 
 		 248 aa  278  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  60.99 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  61.5 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.33 
 
 		 273 aa  274  9e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  59.73 
 
 		 229 aa  271  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.39 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  59.64 
 
 		 406 aa  270  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.71 
 
 		 271 aa  268  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  59.19 
 
 		 236 aa  268  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.74 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  57.02 
 
 		 239 aa  261  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  55.11 
 
 		 241 aa  258  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  56.58 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  55.08 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  56.39 
 
 		 252 aa  248  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.19 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  56 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.64 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 		 246 aa  244  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  51.07 
 
 		 257 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  58.74 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  52.79 
 
 		 286 aa  239  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  51.5 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.26 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  51.07 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.47 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 231 aa  224  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 244 aa  224  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  52.68 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.07 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 		 228 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.33 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  49.17 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  52 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  50.21 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  47.66 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  47.66 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  46.58 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  46.58 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  46.58 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  46.58 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  46.58 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  46.58 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  46.58 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.98 
 
 		 223 aa  208  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>