231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4630 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 461 aa  883    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  77.88 
 
 		 463 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  70.05 
 
 		 441 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  68.76 
 
 		 434 aa  568  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  70.05 
 
 		 450 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  69.82 
 
 		 450 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  72.3 
 
 		 462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  65.88 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  68.76 
 
 		 442 aa  511  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  65.16 
 
 		 447 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.7 
 
 		 449 aa  498  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  64.37 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  66.19 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  64.68 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  66.44 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  60.32 
 
 		 446 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.97 
 
 		 436 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.58 
 
 		 461 aa  475  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.9 
 
 		 436 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  60.33 
 
 		 453 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  58.9 
 
 		 436 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  59.9 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  52.53 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  51.83 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  50.86 
 
 		 414 aa  358  8e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  54.66 
 
 		 440 aa  345  8.999999999999999e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  48.57 
 
 		 433 aa  342  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  54.2 
 
 		 539 aa  341  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  49.88 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  51.49 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  56.35 
 
 		 431 aa  319  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  48.4 
 
 		 402 aa  316  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  49.62 
 
 		 413 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  48.85 
 
 		 401 aa  306  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  48.97 
 
 		 390 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  49.49 
 
 		 436 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  53.58 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.24 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  44.5 
 
 		 404 aa  261  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.49 
 
 		 389 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.49 
 
 		 389 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.49 
 
 		 389 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.49 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.49 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  42.38 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.19 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.53 
 
 		 389 aa  256  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.27 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  38.12 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  39 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.23 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.97 
 
 		 391 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  39.02 
 
 		 383 aa  250  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.59 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  43.2 
 
 		 445 aa  249  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  39.43 
 
 		 424 aa  249  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.85 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.52 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.24 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.65 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  39.8 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  41.41 
 
 		 876 aa  244  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.84 
 
 		 400 aa  243  7e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.75 
 
 		 397 aa  242  7.999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  39.6 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.07 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  41.93 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.32 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.32 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.32 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.32 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.32 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.22 
 
 		 399 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.15 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.85 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.74 
 
 		 391 aa  237  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.53 
 
 		 392 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.84 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.85 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.98 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.1 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  38.31 
 
 		 408 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.58 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  34.99 
 
 		 396 aa  232  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  39.39 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.97 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.64 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  41.36 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.23 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  41.76 
 
 		 481 aa  229  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  39.45 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  41.83 
 
 		 399 aa  229  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  39.42 
 
 		 464 aa  229  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  39.11 
 
 		 401 aa  229  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  35.46 
 
 		 391 aa  229  8e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.55 
 
 		 388 aa  229  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>