More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4604 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  63.03 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  61.32 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  58.77 
 
 		 217 aa  254  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  57.87 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  58.22 
 
 		 221 aa  245  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  57.55 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  52.13 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  50.94 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  54.93 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  49.05 
 
 		 220 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  51.43 
 
 		 222 aa  207  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  49.76 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  47.42 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  48.34 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  49.52 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  49.05 
 
 		 222 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  49.05 
 
 		 222 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  49.05 
 
 		 222 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  49.29 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  51.43 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  46.45 
 
 		 223 aa  188  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  45.97 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  44.86 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  45.5 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  50.24 
 
 		 225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  45.71 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  50.68 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  41.23 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.55 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  38.89 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  43.33 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  38.89 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  42.65 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.48 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  44.76 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.51 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  36.2 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  39.05 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  32.13 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  34.63 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  34.25 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  28.97 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  34.88 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  33.03 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  37.38 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  35.19 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  34.43 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  31.36 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  29.72 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  28.97 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  28.04 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  35.51 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  27.23 
 
 		 233 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  32.09 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.54 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.92 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  32.24 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  33.64 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  32.71 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  31.65 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  31.96 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  36.54 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3556  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  31.56 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2550  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  31.56 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  33.97 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  30.84 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  32.55 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  31.53 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.24 
 
 		 247 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  33.79 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  27.35 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  30.37 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  30.62 
 
 		 240 aa  101  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  30.41 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3602  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  31.94 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  31.92 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>