More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4561 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  100 
 
 		 424 aa  804    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  57.91 
 
 		 409 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  57.28 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  52.76 
 
 		 415 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  54.74 
 
 		 412 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  52.01 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  53.1 
 
 		 413 aa  352  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  50.79 
 
 		 449 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  48.49 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  53.58 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  51.88 
 
 		 447 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  52.13 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  50.37 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  46.59 
 
 		 475 aa  300  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  47.34 
 
 		 465 aa  282  7.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  42.66 
 
 		 462 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  48.13 
 
 		 487 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  48.72 
 
 		 485 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  39.49 
 
 		 483 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  47.73 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  47.97 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  38.68 
 
 		 482 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  36.65 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  45.26 
 
 		 403 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.61 
 
 		 464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.61 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.64 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.88 
 
 		 464 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.61 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.61 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.97 
 
 		 464 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.97 
 
 		 464 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.61 
 
 		 464 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  48.7 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.61 
 
 		 464 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  41.55 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  48.41 
 
 		 383 aa  193  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  38.64 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  38.38 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.69 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  41.79 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  48.84 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  36.08 
 
 		 399 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  37.37 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  44.48 
 
 		 484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  35.23 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  33.81 
 
 		 495 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  35.31 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  32.41 
 
 		 460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  46.72 
 
 		 414 aa  183  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  36.44 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  48.39 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  36.08 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  36.08 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  36.39 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  36.12 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  42.18 
 
 		 455 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  40.43 
 
 		 399 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  40.43 
 
 		 399 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  36.6 
 
 		 402 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  45.62 
 
 		 476 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  45.62 
 
 		 476 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  41.95 
 
 		 469 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  36.08 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.69 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  34.69 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  40.57 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  29.86 
 
 		 473 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  37.84 
 
 		 554 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  36.05 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.48 
 
 		 492 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.48 
 
 		 484 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  40.48 
 
 		 451 aa  176  9e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.48 
 
 		 484 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  39.27 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  36.06 
 
 		 498 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  37.68 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  45.93 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  39.22 
 
 		 391 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.04 
 
 		 476 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  40 
 
 		 398 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  40.84 
 
 		 467 aa  172  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  46.9 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.7 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  38.57 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  43.38 
 
 		 376 aa  169  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  46.51 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  38.57 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  38.57 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  42.65 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  39.03 
 
 		 506 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  35.52 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  34.93 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  34.93 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  45.91 
 
 		 407 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  35.22 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  35.22 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  35.22 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  35.22 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>