More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4523 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  100 
 
 		 239 aa  478  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  82.83 
 
 		 235 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  81.47 
 
 		 235 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  81.47 
 
 		 235 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  81.47 
 
 		 235 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  76.96 
 
 		 238 aa  371  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  77.39 
 
 		 238 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  84.62 
 
 		 238 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  81.36 
 
 		 237 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  81.86 
 
 		 239 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  82.01 
 
 		 239 aa  364  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  82.33 
 
 		 235 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  74.68 
 
 		 236 aa  359  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  74.67 
 
 		 235 aa  359  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  77.54 
 
 		 238 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  84.35 
 
 		 237 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  83.03 
 
 		 238 aa  355  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  78.3 
 
 		 237 aa  351  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  70.39 
 
 		 238 aa  348  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  68.62 
 
 		 259 aa  346  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  69.33 
 
 		 238 aa  345  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  75.21 
 
 		 259 aa  344  8e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  72.53 
 
 		 235 aa  343  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  70.26 
 
 		 236 aa  342  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  72.1 
 
 		 235 aa  341  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  73.36 
 
 		 236 aa  340  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  73.39 
 
 		 237 aa  338  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  68.64 
 
 		 238 aa  338  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  74.03 
 
 		 238 aa  338  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  68.8 
 
 		 237 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  75.11 
 
 		 239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  71.67 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  69.06 
 
 		 225 aa  328  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  66.81 
 
 		 239 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  67.84 
 
 		 230 aa  318  7e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  66.23 
 
 		 231 aa  308  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 231 aa  305  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  60.43 
 
 		 235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17280  50S ribosomal protein L1  69.81 
 
 		 235 aa  299  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  60.53 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  64.13 
 
 		 230 aa  292  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  60.34 
 
 		 235 aa  291  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  56.07 
 
 		 242 aa  287  8e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  59.13 
 
 		 233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 231 aa  282  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  60.53 
 
 		 233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 230 aa  278  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  57.46 
 
 		 231 aa  275  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  64.47 
 
 		 232 aa  275  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  59.21 
 
 		 230 aa  272  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  58.52 
 
 		 232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  60.96 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  58.74 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  62.56 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 229 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  57.45 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 230 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  56.47 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 230 aa  262  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 226 aa  263  3e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 233 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  56.39 
 
 		 232 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  52.07 
 
 		 242 aa  261  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  55.36 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  60.89 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  56.36 
 
 		 229 aa  258  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  57.46 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  56.56 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  55.56 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 232 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 		 231 aa  254  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3327  50S ribosomal protein L1  57.46 
 
 		 240 aa  254  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24535  normal  0.407372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 232 aa  254  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  56.39 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  58.29 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  57.47 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>