More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4418 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
218 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  47.85 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  46.07 
 
 
201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  45.36 
 
 
193 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  43.26 
 
 
201 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  38.97 
 
 
200 aa  141  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  45.56 
 
 
183 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  40.96 
 
 
197 aa  131  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 
204 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  40.96 
 
 
197 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  38.5 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  44.51 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  44.51 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  44.51 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  41.46 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  41.46 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 
191 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  36.07 
 
 
206 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  37.31 
 
 
198 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
567 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  33.71 
 
 
449 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  31.79 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  33.52 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  29.58 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  32.78 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  28.14 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  31.06 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  28.14 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  28.32 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.4 
 
 
14916 aa  73.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  34.25 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  31.63 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  29.35 
 
 
358 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  30.27 
 
 
266 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 
401 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  29.41 
 
 
600 aa  71.6  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  27.17 
 
 
401 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  28.65 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  30.26 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  33.18 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.4 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30.53 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  34.65 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  44.09 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  44.09 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32.16 
 
 
311 aa  68.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 
309 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  21.21 
 
 
367 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  21.21 
 
 
367 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  28.64 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.61 
 
 
319 aa  68.6  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  31.9 
 
 
392 aa  68.2  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  27.17 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  31.77 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  34.18 
 
 
299 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  31.46 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  33.53 
 
 
453 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 
441 aa  66.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  29.9 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  29.9 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  34.69 
 
 
745 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  32.49 
 
 
433 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  37.04 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 
363 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 
485 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  36.75 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  27.53 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  29.48 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  28.14 
 
 
521 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 
1033 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  35.85 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.2 
 
 
355 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  35.78 
 
 
143 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  32.23 
 
 
452 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.7 
 
 
356 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.45 
 
 
389 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  32.96 
 
 
381 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  33.13 
 
 
263 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  27.68 
 
 
576 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  31.29 
 
 
903 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  22.3 
 
 
213 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.79 
 
 
332 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  32.04 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  29.26 
 
 
273 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  29.05 
 
 
349 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  22.36 
 
 
191 aa  62.4  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  29.88 
 
 
776 aa  62  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  31.02 
 
 
278 aa  62  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  32.58 
 
 
180 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  28.19 
 
 
267 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  24.88 
 
 
218 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  27.05 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  29.86 
 
 
370 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  29.19 
 
 
456 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  30.5 
 
 
245 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>