183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4360 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  100 
 
 		 986 aa  1825    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  41.63 
 
 		 986 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  40.87 
 
 		 989 aa  429  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  42.25 
 
 		 962 aa  426  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  30.06 
 
 		 1018 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  29.43 
 
 		 1018 aa  324  6e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  29.59 
 
 		 1018 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  23.87 
 
 		 1039 aa  293  9e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  25.6 
 
 		 1029 aa  280  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  25.56 
 
 		 1049 aa  278  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  25.21 
 
 		 1029 aa  277  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  22.85 
 
 		 1009 aa  276  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  24.49 
 
 		 1029 aa  274  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  26.38 
 
 		 1018 aa  271  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  25.19 
 
 		 1029 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  24.18 
 
 		 1029 aa  268  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  24.18 
 
 		 1029 aa  268  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  24.34 
 
 		 1029 aa  268  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  24.25 
 
 		 1029 aa  266  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  24.25 
 
 		 1029 aa  266  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  24.36 
 
 		 1029 aa  263  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  37.75 
 
 		 995 aa  257  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  21.9 
 
 		 1009 aa  243  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  21.9 
 
 		 1009 aa  243  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  39.69 
 
 		 881 aa  242  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  41.99 
 
 		 995 aa  234  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  37.13 
 
 		 1025 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  44.37 
 
 		 1291 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  37.39 
 
 		 1020 aa  204  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  31.02 
 
 		 1020 aa  197  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  33.33 
 
 		 953 aa  196  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  51.86 
 
 		 1058 aa  195  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  62.07 
 
 		 1023 aa  194  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  38.42 
 
 		 1047 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  51.05 
 
 		 1191 aa  187  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  48.13 
 
 		 1249 aa  187  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  28.02 
 
 		 1018 aa  184  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  27.84 
 
 		 1018 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  39.41 
 
 		 1046 aa  181  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  32.29 
 
 		 1018 aa  180  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  30.27 
 
 		 1013 aa  178  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  46.23 
 
 		 1020 aa  177  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  54.76 
 
 		 1009 aa  171  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  32.74 
 
 		 1029 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  29.14 
 
 		 1018 aa  168  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  32.42 
 
 		 1030 aa  168  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  37.92 
 
 		 1018 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  52.48 
 
 		 1017 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  48.28 
 
 		 1018 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  48.28 
 
 		 1018 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  37.83 
 
 		 1018 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  47.7 
 
 		 1018 aa  160  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  48.28 
 
 		 1018 aa  160  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  39.75 
 
 		 1081 aa  152  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  30.49 
 
 		 1024 aa  150  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  45.41 
 
 		 1006 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  45.24 
 
 		 1022 aa  139  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  37.44 
 
 		 1018 aa  135  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  36.7 
 
 		 1038 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  24.96 
 
 		 1059 aa  125  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  28.47 
 
 		 1033 aa  124  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  27.18 
 
 		 1085 aa  121  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  31.98 
 
 		 1046 aa  119  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  41.25 
 
 		 1091 aa  117  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  40.54 
 
 		 1307 aa  110  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  42.95 
 
 		 906 aa  109  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  40.54 
 
 		 1303 aa  109  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  41.08 
 
 		 1101 aa  109  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  39.38 
 
 		 1088 aa  108  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  38.46 
 
 		 1223 aa  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  38.51 
 
 		 1346 aa  107  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  31.91 
 
 		 1091 aa  106  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  30.67 
 
 		 1011 aa  105  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  38.5 
 
 		 1238 aa  104  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  40.45 
 
 		 1108 aa  104  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  31.8 
 
 		 1223 aa  104  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 1230 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  33.67 
 
 		 1213 aa  103  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  38.76 
 
 		 1224 aa  103  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  41.92 
 
 		 910 aa  102  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  34.1 
 
 		 1214 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  45.53 
 
 		 1214 aa  101  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  35.93 
 
 		 1211 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  45.53 
 
 		 1211 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  45.53 
 
 		 1214 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  29.61 
 
 		 1219 aa  100  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  45.53 
 
 		 1214 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  40.54 
 
 		 1226 aa  99.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  45.53 
 
 		 1214 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  48.6 
 
 		 1214 aa  99  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  29.64 
 
 		 1180 aa  97.8  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  41.36 
 
 		 1164 aa  97.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  37.19 
 
 		 824 aa  96.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  49.22 
 
 		 1227 aa  95.9  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  32.26 
 
 		 1165 aa  95.1  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  42.02 
 
 		 1234 aa  94  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  41.88 
 
 		 1227 aa  94  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  39.16 
 
 		 1226 aa  94  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  34.13 
 
 		 1144 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  44.76 
 
 		 1114 aa  92.8  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>