More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4318 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
310 aa  609  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  61.15 
 
 
297 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  58.03 
 
 
296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  58.03 
 
 
296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  58.03 
 
 
296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  55.68 
 
 
291 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  58.67 
 
 
288 aa  291  7e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  55.51 
 
 
291 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  55.23 
 
 
301 aa  285  9e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  53.29 
 
 
303 aa  281  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  53.57 
 
 
307 aa  281  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  51.99 
 
 
305 aa  278  8e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  53.85 
 
 
326 aa  275  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  55.89 
 
 
285 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  47.91 
 
 
301 aa  232  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
312 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  38.62 
 
 
281 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
313 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
329 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  37.24 
 
 
307 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
318 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  28.83 
 
 
318 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  25.98 
 
 
297 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  24.73 
 
 
297 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
325 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
324 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
318 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
324 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
310 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
324 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
329 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
282 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
314 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
290 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
318 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  32.31 
 
 
274 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
312 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
293 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 
294 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
334 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  25.1 
 
 
296 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
308 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
705 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  29.08 
 
 
907 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
324 aa  95.9  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
360 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  23.67 
 
 
652 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  31.92 
 
 
275 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
336 aa  92.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
1340 aa  92.4  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.58 
 
 
379 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  21.71 
 
 
346 aa  91.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
401 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  29.83 
 
 
358 aa  90.5  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
289 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  24.91 
 
 
336 aa  89.7  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
361 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 
315 aa  89  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
294 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
322 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
287 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  24.25 
 
 
338 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  26.64 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  26.64 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4485  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  34.26 
 
 
884 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
355 aa  86.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.62 
 
 
836 aa  87  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.39 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
279 aa  86.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
322 aa  86.3  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
306 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>