18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4294 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4294  putative integral membrane protein  100 
 
 		 348 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  34.64 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  40.36 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  39.38 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4083  hypothetical protein  34.18 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  40.93 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0741  hypothetical protein  36.27 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1370  hypothetical protein  32.89 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  34.91 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7625  putative integral membrane protein  37.37 
 
 		 451 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  38.89 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  35.64 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1327  hypothetical protein  38.29 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299611  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2359  hypothetical protein  38.94 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.986223  hitchhiker  0.00967269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3864  hypothetical protein  35.45 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2552  hypothetical protein  32.52 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3850  hypothetical protein  23.59 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1960  hypothetical protein  25.47 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>